[發(fā)明專利]一種輔助鑒定大豆抗花葉病毒病基因的方法及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410373427.6 | 申請日: | 2014-07-31 |
| 公開(公告)號: | CN104141011A | 公開(公告)日: | 2014-11-12 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 韓英鵬;趙雪;李海燕;李文濱 | 申請(專利權(quán))人: | 東北農(nóng)業(yè)大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京愛普納杰專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 11419 | 代理人: | 何自剛;王玉松 |
| 地址: | 150030 黑龍*** | 國省代碼: | 黑龍江;23 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 輔助 鑒定 大豆 花葉 病毒 基因 方法 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種輔助鑒定大豆抗花葉病毒病基因的方法,其特征在于,從待測大豆中分離提取DNA,通過分子標(biāo)記SSR64和SG1的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,再利用電泳檢測SSR64引物擴(kuò)增產(chǎn)物中有無標(biāo)記基因位點(diǎn)條帶和/或利用基因分型分析系統(tǒng)分析SG1的引物擴(kuò)增產(chǎn)物的基因型,確定待測大豆種質(zhì)資源是否具有抗花葉病毒病基因。
2.權(quán)利要求1所述方法,其特征在于,步驟如下:
1)提取待測大豆樣本的DNA;
2)以步驟1)所提取的DNA為模板,通過分子標(biāo)記SSR64的引物和分子標(biāo)記SG1的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
3)利用電泳檢測步驟2)所得SSR64的引物的擴(kuò)增產(chǎn)物和/或利用基因分型分析系統(tǒng)分析SG1引物擴(kuò)增產(chǎn)物的基因型,確定待測大豆種質(zhì)資源是否具有標(biāo)記基因位點(diǎn)條帶。
3.權(quán)利要求1或2所述方法,其特征在于,所述分子標(biāo)記SSR64的引物如SEQ?ID?NO.1-NO.2所示;所述分子標(biāo)記SG1的引物如EQ?ID?NO.3-NO.4所示。
4.權(quán)利要求1或2所述方法,其特征在于,所述PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)?4℃預(yù)變性6min,94℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,35次循環(huán),72℃終延伸5min。
5.權(quán)利要求1或2所述方法,其特征在于,所述標(biāo)記基因位點(diǎn),編號RsmvN1-2,位于大豆的F連鎖群。
6.權(quán)利要求5所述方法,其特征在于,所述標(biāo)記基因位點(diǎn),具體位于抗大豆花葉病毒病基因共分離的分子標(biāo)記SSR64和SG1之間,并與分子標(biāo)記SSR64和SG1緊密連鎖。
7.權(quán)利要求1或2所述方法,其特征在于,所述標(biāo)記基因位點(diǎn)條帶,SSR64引物擴(kuò)增的產(chǎn)物大小為152bp,SG1引物擴(kuò)增的產(chǎn)物大小為80bp。
8.權(quán)利要求1或2所述方法,其特征在于,所述基因分型分析系統(tǒng)分析,是將SG1引物PCR擴(kuò)增產(chǎn)物離心后,掃描樣品的熒光信號,掃描起始溫度為70℃,結(jié)束溫度96℃,掃描結(jié)束后溫度降至67℃,判斷掃描所得溶解曲線是否發(fā)生變異。
9.權(quán)利要求1或2所述方法,其特征在于,具體步驟如下:
1)提取待測大豆樣品葉片中的DNA;
2)以步驟1)所提取的DNA為模板,再分別通過SEQ?ID?NO.1-NO.2所示分子標(biāo)記SSR64的引物和SEQ?ID?NO.3-NO.4所示分子標(biāo)記SG1的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)?4℃預(yù)變性6min,94℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,35次循環(huán),72℃終延伸5min;
3)利用聚丙烯酰胺凝膠電泳分離檢測步驟2)所得的分子標(biāo)記SSR64引物的擴(kuò)增產(chǎn)物,檢測是否含有大小為152bp的條帶;
4)利用Lightscanner基因分型分析系統(tǒng)分析步驟2)所得的分子標(biāo)記SG1引物的擴(kuò)增產(chǎn)物的基因型,將所得的擴(kuò)增產(chǎn)物于4000rpm下離心5min,再對樣品的熒光信號進(jìn)行掃描,掃描初始溫度為70℃,結(jié)束溫度為96℃,掃描結(jié)束后降溫至67℃,判斷掃描所得熔解曲線是否存在變異。
10.權(quán)利要求1-9所述方法,用于大豆抗花葉病毒病基因的鑒定、篩選和大豆的遺傳育種。
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