[發明專利]檢測CX3CR1基因V249I突變位點的方法和引物無效
申請號: | 201410366629.8 | 申請日: | 2014-07-29 |
公開(公告)號: | CN104195234A | 公開(公告)日: | 2014-12-10 |
發明(設計)人: | 王淑一;陳奕磊;林筱劍 | 申請(專利權)人: | 杭州艾迪康醫學檢驗中心有限公司 |
主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江杭州金通專利事務所有限公司 33100 | 代理人: | 徐關壽 |
地址: | 310023 浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索關鍵詞: | 檢測 cx3cr1 基因 v249i 突變 方法 引物 | ||
1.檢測CX3CR1基因V249I突變位點的引物,其特征在于,包括:擴增CX3CR1基因V249I突變位點的正、反向引物;其堿基序列為:
V249I-F:GAGTTATTGCTACTTCAGAA
V249I-R:GTAAAGGTATCTTCTGAACT。
2.如權利要求1所述的引物,其特征在于,所述引物還包括正向測序引物,其堿基序列為:
V249I-S-F:GAGTTATTGCTACTTCAGAA。
3.如權利要求1至2之一所述的引物,其特征在于,所述正、反向引物的使用濃度比為:V249I-F?:?V249I-R=1:1。
4.如權利要求1至2之一所述的引物,其特征在于,所述正向測序引物V249I-S-F的使用濃度3.2uM。
5.如權利要求1所述的引物,其特征在于,所述正、反向擴增引物的擴增反應條件為:第一階段,95?℃?預變性10min;第二階段,變性溫度94?℃?30sec,退火溫度58?℃?90sec,延伸溫度72?℃?30sec,循環35次,第三階段,72?℃?10min;第四階段,擴增反應結束,擴增產物在4?℃下保存。
6.一種檢測CX3CR1基因V249I突變位點的方法,其包括如下步驟:
(1)提取樣本DNA;
(2)利用一對擴增引物V249I-F和V249I-R對(1)中的DNA進行擴增,獲得擴增產物;
(3)利用正向測序引物V249I-S-F對(2)中的擴增產物進行測序,獲得所述擴增產物的基因序列;
(4)將(3)中的基因序列與CX3CR1基因野生型參考序列CX3CR1-ref進行比較,確定突變位點是否存在,其特征在于,
V249I-F:GAGTTATTGCTACTTCAGAA
V249I-R:GTAAAGGTATCTTCTGAACT
V249I-S-F:GAGTTATTGCTACTTCAGAA。
7.如權利要求6所述的方法,其特征在于,步驟(2)的擴增反應條件為:第一階段,95?℃?預變性10min;第二階段,變性溫度94?℃?30sec,退火溫度64?℃?90sec,延伸溫度72?℃?30sec,循環35次;第三階段,72?℃?10min;第四階段,擴增反應結束,擴增產物在4?℃下保存。
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