[發(fā)明專利]一種可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭及檢測(cè)方法和應(yīng)用有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201410345866.6 | 申請(qǐng)日: | 2014-07-18 |
| 公開(公告)號(hào): | CN104178566A | 公開(公告)日: | 2014-12-03 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 趙建;朱新平;李偉;王亞坤;文萍 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州知友專利商標(biāo)代理有限公司 44104 | 代理人: | 宣國(guó)華 |
| 地址: | 510380 廣*** | 國(guó)省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 用于 衛(wèi)星 檢測(cè) 多重 熒光 pcr 通用 接頭 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭,其特征是:包括4條接頭,分別為接頭1、接頭2、接頭3和接頭4,接頭1~4的核苷酸序列如SEQ?ID:1~4中所示。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭,其特征是:對(duì)于5色熒光系統(tǒng),選用4條接頭,對(duì)于4色熒光系統(tǒng),選用4條接頭中的3條接頭即可。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭,其特征是:所述4條接頭可與4種不同的熒光任意組合。
4.一種利用權(quán)利要求1所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭進(jìn)行微衛(wèi)星多重?zé)晒釶CR檢測(cè)方法,其特征是包括以下步驟:
(1)選取樣品,提取樣品的基因組DNA;
(2)合成多個(gè)微衛(wèi)星引物的接頭-正向引物、反向引物及熒光標(biāo)記接頭;
(3)將每個(gè)微衛(wèi)星引物的接頭-正向引物與反向引物混合,再將各個(gè)微衛(wèi)星引物混合,得混合引物,在混合引物中加入熒光標(biāo)記接頭,作為多重PCR的引物;
(4)將多重PCR的引物加入到PCR反應(yīng)體系中,進(jìn)行正常多重PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物用ABI遺傳分析儀進(jìn)行分析,獲得樣品的各微衛(wèi)星位點(diǎn)的擴(kuò)增圖譜。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭進(jìn)行微衛(wèi)星多重?zé)晒釶CR檢測(cè)方法,其特征是:步驟(2)中對(duì)于5色熒光系統(tǒng),所述熒光標(biāo)記接頭為4條熒光標(biāo)記接頭,所述熒光為FAM、VIC、PET和NED四色熒光,對(duì)于4色熒光系統(tǒng),所述熒光標(biāo)記接頭為3條熒光標(biāo)記接頭,所述熒光為FAM、JOE和NED三色熒光。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭進(jìn)行微衛(wèi)星多重?zé)晒釶CR檢測(cè)方法,其特征是:步驟(2)中在標(biāo)記同一熒光的正向引物前連接同一接頭,以避免每個(gè)正向引物都需要進(jìn)行熒光標(biāo)記。
7.根據(jù)權(quán)利要求4所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭進(jìn)行微衛(wèi)星多重?zé)晒釶CR檢測(cè)方法,其特征是:步驟(3)中將每個(gè)微衛(wèi)星引物的接頭-正向引物與反向引物按1:40的摩爾比混合。
8.根據(jù)權(quán)利要求4所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭進(jìn)行微衛(wèi)星多重?zé)晒釶CR檢測(cè)方法,其特征是:步驟(3)中所述熒光標(biāo)記接頭的摩爾用量與反向引物的摩爾用量相同。
9.根據(jù)權(quán)利要求4所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭進(jìn)行微衛(wèi)星多重?zé)晒釶CR檢測(cè)方法,其特征是:步驟(4)中多重PCR的反應(yīng)體系為10μL,包括AB?Multiplex?PCR?Master?Mix5μL,混合引物2μL,熒光標(biāo)記接頭0.2μL,去離子水1.8μL,DNA20ng。
10.權(quán)利要求1所述的可用于微衛(wèi)星檢測(cè)的多重?zé)晒釶CR通用接頭在微衛(wèi)星的多重PCR檢測(cè)方面的應(yīng)用。
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