[發(fā)明專利]鱖魚彈狀病毒的檢測試劑盒及檢測方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410315460.3 | 申請日: | 2014-07-02 |
| 公開(公告)號: | CN104032038A | 公開(公告)日: | 2014-09-10 |
| 發(fā)明(設計)人: | 雷燕;張會軍;劉婉;王惠儒;張文文 | 申請(專利權)人: | 廣州金水動物保健品有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 510510 廣東省廣州市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 鱖魚 彈狀病毒 檢測 試劑盒 方法 | ||
技術領域
本發(fā)明屬于水產動物病原的檢測與診斷技術領域,涉及一種鱖魚彈狀病毒的檢測方法,特別是一種采用逆轉錄-聚合酶鏈式反應(簡稱RT-PCR)技術檢測鱖魚彈狀病毒的方法。?
背景技術
近年來,廣東省的佛山、中山,山東的濟寧以及湖北等地的烏鱧、鱖魚、加州鱸魚養(yǎng)殖場爆發(fā)大規(guī)模的流行性疾病,造成巨大的經濟損失。實驗室從細菌學和病毒學兩方面對患病魚進行檢測分析,確認引起這些養(yǎng)殖魚類暴發(fā)性死亡的疾病為彈狀病毒病,其病原為鱖魚彈狀病毒(Siniperca?chuatsi?rhabdovirus,SCRV)。?
彈狀病毒(Rhabdovirus)是一種單股不分節(jié)段的負鏈RNA病毒,病毒粒子大小為(100-430)nm×(45-100)nm,形態(tài)似棒狀或子彈狀。彈狀病毒種類較多,包括175種以上的成員,可感染脊椎動物、無脊椎動物及植物。魚類彈狀病毒因感染宿主廣、毒株種類多、毒力強,嚴重危害各種淡水和海水魚。迄今報道感染魚類的彈狀病毒已有二十多種,其中危害較大的有鯉春病毒血癥病毒(SVCV)。病毒性出血性敗血癥病毒(VHSV)、傳染性造血器官壞死病毒(IHNV)、牙鲆彈狀病毒(HRV)和鱖魚彈狀病毒(SCRV)等。通過調查了解發(fā)現(xiàn),自然感染鱖魚彈狀病毒的烏鱧、鱖魚、加州鱸魚死亡率高達90%。為了及早發(fā)現(xiàn)養(yǎng)殖魚類是否被SCRV感染,有必要建立一種快速、準確、靈敏的檢測方法。?
傳統(tǒng)病毒病的診斷需要進行病毒分離,細胞培養(yǎng),電鏡觀察以及免疫檢測等方法,缺乏對病毒進行快速、準確、敏感的檢測方法。PCR方法具有操作簡單、特異、快速、敏感等優(yōu)點,正逐步應用于病原微生物的檢測與研究中。?
發(fā)明內容
本發(fā)明所要解決的技術問題是,克服現(xiàn)有技術的不足,提供一種鱖魚彈狀病毒的逆轉錄-聚合酶鏈式反應檢測方法,能快速、高效地用于鱖魚彈狀病毒的檢測。?
鱖魚彈狀病毒的逆轉錄-聚合酶鏈式反應檢測試劑盒,所述試劑盒包括:?
(1)5×逆轉錄緩沖液100μL;?
(2)逆轉錄酶25μL;?
(3)隨機引物25μL;?
(4)2×聚合酶鏈式反應混合緩沖液1.0mL,包含以下成分:?
(5)檢測引物的設計合成:根據(jù)GenBank中發(fā)布的鱖魚彈狀病毒的基因序列,在其保守序列設計一對特異性檢測引物,上游引物P1:5’-ATAAGGGTAGTTGAGAAGAAG-3’,下游引物P2:5’-CTTCTTGTTGCTCTTCTTAAA-3’,濃度為10μM;?
(6)Taq酶?????????5U/μL;?
(7)滅菌的ddH2O???1.0mL;?
(8)陽性對照液:提取鱖魚彈狀病毒總RNA,逆轉錄獲得cDNA,然后以cDNA為模板,以Pl、P2為引物,進行PCR擴增,將回收純化的擴增產物連接到pMD18-T載體,以陽性克隆的重組質粒作為陽性對照;?
(9)陰性對照液:以ddH2O作為陰性對照。?
采用試劑盒檢測鱖魚彈狀病毒的方法為:?
(1)待測樣品RNA的提取:解剖待檢測的魚樣品,取肝、脾、腎等組織進行勻漿,采用傳統(tǒng)的Trizol法或者商業(yè)化的RNA提取試劑盒提取RNA,用ddH2O溶解,即為試驗用RNA模板;?
(2)逆轉錄合成cDNA:取待測樣品的RNA模板7μL,加入PCR反應管中,再加入5×逆轉錄緩沖液2μL、逆轉錄酶0.5μL、隨機引物0.5μL,反應總體積10μL,充分混勻后,置于PCR儀上,37℃15min逆轉錄反應,85℃5sec滅活逆轉錄,得到cDNA產物;?
(3)PCR擴增:采用25μL的PCR反應體系,在0.2mL?PCR反應管內分別加入2×反應混合緩沖液12.5μL,上游引物P1、下游引物P2各0.5μL,5U/μL?Taq?DNA聚合酶0.5μL,cDNA模板3.0μL,用滅菌超純水加至總體積,同時分別用陽性對照液和陰性對照液作為模板,設置陽性和陰性對照組,混合均勻后離心數(shù)秒進行PCR反應,反應程序為:94℃預變性5分鐘;然后94℃變性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸30秒,共循環(huán)35次;72℃延伸10分鐘,最后4℃保存;?
(4)PCR擴增產物的檢測:PCR反應結束后,取10μL產物在1.5%瓊脂糖凝膠(含溴化乙錠0.5μg/mL)上,使用TAE緩沖液進行電泳,在紫外透射儀下觀察PCR產物,檢查PCR產物的預期大小;?
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