[發明專利]一種桉樹焦枯病原菌的LAMP檢測試劑盒及其使用方法有效
| 申請號: | 201410273167.5 | 申請日: | 2014-06-18 |
| 公開(公告)號: | CN104164486A | 公開(公告)日: | 2014-11-26 |
| 發明(設計)人: | 朱天輝;張靜;朱涵明月;李姝江;譙天敏;韓珊;王淋敏;張麗娜 | 申請(專利權)人: | 四川農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 北京眾合誠成知識產權代理有限公司 11246 | 代理人: | 龔燮英 |
| 地址: | 611130 四*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 桉樹 焦枯 病原菌 lamp 檢測 試劑盒 及其 使用方法 | ||
1.一種桉樹焦枯病原菌的LAMP檢測試劑盒,其特征在于,其包括:
(1)10×ThermopolⅡ;
(2)100mMMgCl2;
(3)2.5mMdNTPs;
(4)5M甜菜堿溶液;
(5)ddH2O;
(6)40μM的內引物FIP和BIP,10μM的外引物F3和B3;10μM的環狀引物LooPF和LooPB;其中,前內引物FIP的序列為5'-TGCGCGCTCTTTCGCTACATACACAACGGTACCTCCGACC-3',后內引物BIP的序列為5'-CGCTCACCCTGCGAGAAACAGCGCGAGGAACATACTTGTT-3',前外引物F3的序列為5'-CTCGACAGCAATGGTGTCT-3',后外引物B3的序列為5'-GCTCAAGATCGACGAGGAC-3',環狀引物LooPF的序列為5'-GTAGACGTTCATGCGCTCC-3',環狀引物LooPB的序列為5'-ATTATTTGTGAGTGTGATAG-3';
(7)8UBstDNA聚合酶大片;
(8)SYBRGreenI熒光染料。
2.根據權利要求1所述的LAMP檢測試劑盒的使用方法,其特征是,其步驟如下:
(1)提取純培養菌株基因組DNA或所取植物組織樣總DNA;
(2)所述的反應體系50μL,包含:10×ThermopolⅡ2.5μl;100mMMgCl22μl;2.5mMdNTPs3.5μl;5M甜菜堿溶液3.0μl;ddH2O33.0μl;40μM內引物FIP/BIP各1μl;10μM外引物F3/B3各0.5μl;10μM環狀引物LooPF/LooPB各1μl;8UBstDNA聚合酶大片1μl;加純培養菌株基因組DNA或所取植物組織樣總DNA提取液2.0μL,組成反應混合液;
(3)PCR反應條件為:將反應混合液置于65℃的水浴鍋中反應65min,隨后80℃滅活3min結束反應;
(4)結果判定:①用肉眼觀察反應液是否為白色渾濁,白色渾濁即為陽性,否則為陰性;②將反應產物PCR管放在紫外燈下照射,若有白色則說明樣品中存在桉樹焦枯病原菌,無白色則說明不含桉樹焦枯病原菌;③在擴增產物中加入SYBRGreenI熒光染料觀察顏色變化,反應液顏色由橙色變成綠色為陽性,顏色保持不變為陰性;④擴增結束后取5.0μLPCR產物上樣于含0.5μg/mLEB的2%瓊脂糖凝膠上電泳,電壓為9V/cm、時間為30min,在凝膠成像系統上檢測并拍照,觀察是否產生特征性梯狀電泳條帶,有條帶則說明樣品中存在桉樹焦枯病原菌,無條帶則說明不含桉樹焦枯病原菌。
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