[發(fā)明專利]一種檢測及鑒別診斷氣溶膠中布魯氏桿菌的方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410188981.7 | 申請日: | 2014-05-06 |
| 公開(公告)號: | CN103981261A | 公開(公告)日: | 2014-08-13 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 何洪彬;趙貴民;王洪梅 | 申請(專利權(quán))人: | 山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院奶牛研究中心 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 濟(jì)南圣達(dá)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 37221 | 代理人: | 彭成 |
| 地址: | 250100 山東省*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 檢測 鑒別 診斷 氣溶膠 中布魯氏 桿菌 方法 | ||
1.一種檢測及鑒別診斷氣溶膠中布魯氏桿菌的方法,其特征在于:步驟如下:
(1)采集氣溶膠樣本;
(2)提取氣溶膠樣本的基因組總DNA;
(3)檢測:以上述提取的基因組總DNA為模板,采用試劑盒進(jìn)行SYBRGreenⅠ實(shí)時(shí)熒光定量PCR,具體如下:
所述試劑盒由特異性引物、pEASY-T3-VirB10陽性標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒、SYBRGreenⅠ實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑和ddH2O組成;
所述pEASY-T3-VirB10陽性標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒是由序列為SEQIDNO.10所示的DNA片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質(zhì)粒;
所述特異性引物選自①通用檢測引物對或/和②布魯氏桿菌牛種、羊種和豬種鑒別檢測引物對;
所述通用型檢測引物對的序列如下:
VirB10-2-F:5′-TCTTTGTCGTGGGCTTCATCG-3′;
VirB10-2-R:5′-TGGTCTGCACCATCGTCTTGTC-3′;
所述布魯氏桿菌牛種、羊種和豬種鑒別檢測引物對的序列具體如下:
牛種布魯氏桿菌特異性檢測引物對:
Abortus-F:5′-GCGGCTTTTCTATCACGGTATTC-3′;
Abortus-R:5′-GACCGCATTCATGGGTTTCG-3′;
羊種布魯氏桿菌特異性檢測引物對:
Melitensis-F:5′-AACAAGCGGCACCCCTAAAA-3′;
Melitensis-R:5′-CATGCGCTATGATCTGGTTACG-3′;
豬種布魯氏桿菌特異性檢測引物對:
Suis-F:5′-CATGCGCTATGATCTGGTTACG-3′;
Suis-R:5′-ACCGGAACATGCAAATGAC-3′;
(4)建立標(biāo)準(zhǔn)曲線和溶解曲線:建立pEASY-T3-VirB10陽性標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的標(biāo)準(zhǔn)曲線,以及擴(kuò)增體系的溶解曲線;
(5)判斷:當(dāng)所用特異性引物為通用檢測引物對時(shí),若溶解曲線為S型曲線,則表明氣溶膠樣本中含有布魯氏桿菌;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有布魯氏桿菌;
當(dāng)所用特異性引物為布魯氏桿菌牛種、羊種和豬種鑒別檢測引物對時(shí),若對應(yīng)于牛種布魯氏桿菌特異性檢測引物對的溶解曲線為S型,則表明氣溶膠樣本中含有牛種布魯氏桿菌;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有牛種布魯氏桿菌;
若對應(yīng)于羊種布魯氏桿菌特異性檢測引物對的溶解曲線為S型,則表明氣溶膠樣本中含有羊種布魯氏桿菌;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有羊種布魯氏桿菌;
若對應(yīng)于豬種布魯氏桿菌特異性檢測引物對的溶解曲線為S型,則表明氣溶膠樣本中含有豬種布魯氏桿菌;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有豬種布魯氏桿菌。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測及鑒別診斷氣溶膠中布魯氏桿菌的方法,其特征在于:所述步驟(1)中,采集氣溶膠樣本的方法為:采用全玻璃液體沖擊式采樣器,以10mLpH值7.0的磷酸鹽緩沖液為采樣介質(zhì),按照12.5L/min的采樣流量采集20min,收集氣溶膠樣本。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測及鑒別診斷氣溶膠中布魯氏桿菌的方法,其特征在于:所述步驟(2)中,提取基因組總DNA的方法為:將采集到的10mL氣溶膠樣本在室溫下12000r/min離心5min,棄上清液,應(yīng)用細(xì)菌基因組DNA試劑盒提取總DNA。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測及鑒別診斷氣溶膠中布魯氏桿菌的方法,其特征在于:所述步驟(3)中,PCR的擴(kuò)增體系為:20μL的擴(kuò)增體系,包括2×SYBRPremixExTaqII10μL,模板2μL,10μmol/L的上游引物和下游引物各0.5μL,RNaseFreeddH2O7μL。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測及鑒別診斷氣溶膠中布魯氏桿菌的方法,其特征在于:所述步驟(3)中,PCR的擴(kuò)增條件為:預(yù)變性95℃30s,然后按照95℃變性5s、62℃退火延伸30s進(jìn)行40個循環(huán),每個循環(huán)結(jié)束后采集熒光信號;溶解曲線的條件為95℃10s、65℃60s,升溫至95℃,最后50℃30s反應(yīng)結(jié)束。
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