[發明專利]一種檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法及試劑盒有效
| 申請號: | 201410188272.9 | 申請日: | 2014-05-06 |
| 公開(公告)號: | CN103981284A | 公開(公告)日: | 2014-08-13 |
| 發明(設計)人: | 王洪梅;何洪彬 | 申請(專利權)人: | 山東省農業科學院奶牛研究中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 濟南圣達知識產權代理有限公司 37221 | 代理人: | 彭成 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 氣溶膠 口蹄疫病毒 方法 試劑盒 | ||
技術領域
本發明涉及一種通過熒光定量SYBR?Green?I方法分型檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法,以及特異性引物、試劑盒,屬于生物檢測領域。
背景技術
口蹄疫是由口蹄疫病毒引起的豬、牛、羊等偶蹄類動物發生急性、熱性、高度接觸性傳染病,一旦暴發,必須撲殺感染及接觸感染的動物。口蹄疫被世界動物衛生組織列為法定報告疫病,被我國列為一類動物疫病之首,不僅會造成巨大的直接經濟損失,而且嚴重危害畜牧業的健康發展以及相關產品的對外貿易,對國家的政治、經濟具有深遠的影響。
口蹄疫病毒有7個血清型和65個以上的血清亞型,血清型之間無交叉免疫現象,因而難以控制。我國為口蹄疫流行國家,主要流行O型、A型和Asia1型口蹄疫。2005年我國大面積爆發了Asia1型口蹄疫,2009年和2013年爆發了A型口蹄疫,近年來,均有O型口蹄疫的散發和流行,特別是隨著我國養殖業集約化、規模化的迅猛發展,口蹄疫的傳播風險也來越大。
由于養殖動物高度密集,患病動物呼出、排泄大量的病原微生物,造成舍內高濃度微生物氣溶膠的積聚,而且通過舍內外氣體的交換,病原微生物隨著大氣傳播、擴散,造成環境生物污染和傳染病傳播。口蹄疫病毒能在空氣中形成氣溶膠,病毒可隨風散播到50~100公里外的地方,傳播速度快,距離遠,難于防御。因此,通過建立一種適用于口蹄疫病毒氣溶膠的檢測方法,將為口蹄疫預報預警提供配套技術。
目前應用于氣溶膠病毒的檢測方法主要有培養法和分子生物學方法,實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數最敏感、最準確的分子生物學方法,具有靈敏度和特異性高、自動化程度高、無污染、實時和準確等特點,可應用于病原微量檢測。然而關于氣溶膠的口蹄疫病毒熒光定量PCR檢測及其分型方法未見報道。
發明內容
針對上述現有技術,本發明提供了一種通過熒光定量SYBRGreenI方法分型檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法,以及特異性引物、試劑盒。
本發明是通過以下技術方案實現的:
一種檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法,步驟如下:
(1)采集氣溶膠樣本;
進一步地,采集氣溶膠樣本的方法為:采用MS-1型多功能微生物采樣器,以10mL?pH值7.0的磷酸鹽緩沖液(PBS)為采樣介質,按照12.5L/min的采樣流量采集30min,收集養殖場環境中的氣溶膠樣本;
(2)提取氣溶膠樣本中病毒的cDNA;
進一步地,提取cDNA的方法為:取2mL氣溶膠樣本,應用病毒RNA提取試劑盒(商業化產品,現有技術中的常規試劑盒)提取總RNA;再參照反轉錄試劑盒(商業化產品,現有技術中的常規試劑盒)說明書進行反轉錄,獲得cDNA;
(3)檢測:以上述提取的cDNA為模板,采用試劑盒進行SYBRGreenⅠ實時熒光定量PCR,具體如下:
所述試劑盒由特異性引物、RT反應緩沖液、AMV反轉錄酶、Premix?Ex?TaqTM?II、標準陽性質粒、無RNase的水組成。
所述標準陽性質粒包括陽性質粒pEASY-T3-5’UTR、pEASY-T3-O-VP1、pEASY-T3-A-VP1和pEASY-T3-A1-VP1;用于標準曲線的制備及氣溶膠口蹄疫病毒拷貝數的計算。
所述陽性質粒pEASY-T3-5’UTR是由SEQ?ID?NO.9所示序列的第28-203位核苷酸的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒,連接方法為所屬領域常規技術。
所述陽性質粒pEASY-T3-O-VP1是由ID?NO.10所示的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒,連接方法為所屬領域常規技術。
所述陽性質粒pEASY-T3-A-VP1是由SEQ?ID?NO.11所示的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒,連接方法為所屬領域常規技術。
所述陽性質粒pEASY-T3-A1-VP1是由SEQ?ID?NO.12所示的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒,連接方法為所屬領域常規技術。
所述特異性引物選自口蹄疫病毒檢測的通用引物對或/和O型、A型、Asia1型3種血清型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對;
所述口蹄疫病毒檢測的通用引物對的序列如下:
引物1-5’UTR-F:5’-CGTTGCACTCCACACTTAC-3’(SEQ?ID?NO.1);
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