[發明專利]一種檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法及試劑盒有效
| 申請號: | 201410188272.9 | 申請日: | 2014-05-06 |
| 公開(公告)號: | CN103981284A | 公開(公告)日: | 2014-08-13 |
| 發明(設計)人: | 王洪梅;何洪彬 | 申請(專利權)人: | 山東省農業科學院奶牛研究中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 濟南圣達知識產權代理有限公司 37221 | 代理人: | 彭成 |
| 地址: | 250100 山東省*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 氣溶膠 口蹄疫病毒 方法 試劑盒 | ||
1.一種檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法,其特征在于:步驟如下:
(1)采集氣溶膠樣本;
(2)提取氣溶膠樣本中病毒的cDNA;
(3)檢測:以上述提取的cDNA為模板,采用試劑盒進行SYBRGreenⅠ實時熒光定量PCR,具體如下:
所述試劑盒由特異性引物、RT反應緩沖液、AMV反轉錄酶、Premix?Ex?TaqTM?II、標準陽性質粒、無RNase的水組成;
所述標準陽性質粒包括陽性質粒pEASY-T3-5’UTR、pEASY-T3-O-VP1、pEASY-T3-A-VP1和pEASY-T3-A1-VP1;
所述陽性質粒pEASY-T3-5’UTR是由SEQ?ID?NO.9所示序列的第28-203位核苷酸的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒;
所述陽性質粒pEASY-T3-O-VP1是由ID?NO.10所示的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒;
所述陽性質粒pEASY-T3-A-VP1是由SEQ?ID?NO.11所示的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒;
所述陽性質粒pEASY-T3-A1-VP1是由SEQ?ID?NO.12所示的序列片段與pEASY-T3載體相連接后得到的重組質粒;
所述特異性引物選自口蹄疫病毒檢測的通用引物對或/和O型、A型、Asia1型3種血清型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對;
所述口蹄疫病毒檢測的通用引物對的序列如下:
引物1-5’UTR-F:5’-CGTTGCACTCCACACTTAC-3’;
引物2-5’UTR-R:5’-GACCAAGTAGGCGGAAAG-3’;
O型、A型、Asia1型3種血清型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對的序列如下:
O型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對的序列如下:
引物3-O-VP1F:5’-GCAACTCAGGTCCAGAGGCGTC-3’;
引物4-O-VP1R:5’-CAGTGTGTGAGCAGGGATCTGCATC-3’;
A型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對的序列如下:
引物5-A-VP1F:5’-AGACACAGGCTCAGCGACGTC-3’;
引物6-A-VP1R:5’-GGCTGCACGCAAAAGGGCACCCACC-3’;
Asia1型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對的序列如下:
引物7-A1-VP1F:5’-GAAACTCAGACAGCCAGGCGGC-3’;
引物8-A1-VP1R:5’-CGCAGACCGCAGCAGGCTCCAACC-3’;
(4)建立標準曲線和溶解曲線:建立陽性標準質粒的標準曲線,以及擴增體系的溶解曲線;
(5)判斷:當所用特異性引物為口蹄疫病毒檢測的通用引物對時,若溶解曲線為S型曲線,則表明氣溶膠樣本中含有口蹄疫病毒;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有口蹄疫病毒;
當所用特異性引物為O型、A型、Asia1型3種血清型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對時,若對應于O型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對的溶解曲線為S型,則表明氣溶膠樣本中含有O型口蹄疫病毒;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有O型口蹄疫病毒;
若對應于A型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對的溶解曲線為S型,則表明氣溶膠樣本中含有A型口蹄疫病毒;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有A型口蹄疫病毒;
若對應于Asia1型口蹄疫病毒鑒別檢測引物對的溶解曲線為S型,則表明氣溶膠樣本中含有Asia1型口蹄疫病毒;若溶解曲線為一條直線,則表明氣溶膠樣本中不含有Asia1型口蹄疫病毒。
2.根據權利要求1所述的檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法,其特征在于:所述步驟(1)中,采集氣溶膠樣本的方法為:采用MS-1型多功能微生物采樣器,以10mLpH值7.0的磷酸鹽緩沖液為采樣介質,按照12.5L/min的采樣流量采集30min,收集氣溶膠樣本。
3.根據權利要求1所述的檢測氣溶膠中口蹄疫病毒的方法,其特征在于:所述步驟(2)中,提取cDNA的方法為:取2mL氣溶膠樣本,應用病毒RNA提取試劑盒提取總RNA;再應用反轉錄試劑盒進行反轉錄,獲得cDNA。
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