[發(fā)明專利]一種海洋環(huán)境放線菌群落檢測基因芯片及應用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201410148433.1
• 申請日: 2014-04-14
• 公開（公告）號: CN103866044A
• 公開（公告）日: 2014-06-18
• 發(fā)明（設計）人: 王敬敬;黃志勇;梁亞杰;韓一凡;王興彪;張曉霞
• 申請（專利權）人: 中國科學院天津工業(yè)生物技術研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12Q1/04
• 代理公司: 青島海昊知識產(chǎn)權事務所有限公司 37201
• 代理人: 曾慶國

1.一種基因芯片，其特征在于，所述的基因芯片包含有芯片載體，以及固定在芯片載體上的，用于檢測海水中酸微菌科、Iamiaceae菌科、分枝桿菌科、纖維素單胞菌科、間孢囊菌科、微桿菌科、微球菌科、類諾卡氏菌科、丙酸桿菌科和腈基降解菌科的探針；?

其中用于檢測酸微菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:1；?

用于檢測Iamiaceae菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:4；?

用于檢測分枝桿菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:7；?

用于檢測纖維素單胞菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:10；?

用于檢測間孢囊菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:13；?

用于檢測微桿菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:16；?

用于檢測微球菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:19；?

用于檢測類諾卡氏菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:22；?

用于檢測丙酸桿菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:25；?

用于檢測腈基降解菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:28。?

2.如權利要求1所述的基因芯片，其特征在于，所述的用于檢測酸微菌科微生物的核酸探針，包括有核苷酸序列為SEQ?ID?NO:2-3中的任一種或幾種；?

用于檢測Iamiaceae菌科微生物的核酸探針，包括核苷酸序列為SEQ?ID?NO:5-6中的任一種或幾種。?

3.如權利要求1所述的基因芯片，其特征在于，所述的用于檢測分枝桿菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:8或SEQ?ID?NO:9中任一種或幾種；?

用于檢測纖維素單胞菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:11-12中的任一種或幾種。?

4.如權利要求1所述的基因芯片，其特征在于，所述的用于檢測間孢囊菌科微生物的核酸探針，核苷酸序列為SEQ?ID?NO:14-15中的任一種或幾種；?

用于檢測微桿菌科微生物的核酸探針，核苷酸序列為SEQ?ID?NO:17-18任一種或幾種；?

用于檢測微球菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:20-21中的任一種或幾種。?

5.如權利要求1所述的基因芯片，其特征在于，所述的用于檢測類諾卡氏?菌科微生物的核酸探針的核苷酸序列為SEQ?ID?NO:23-24中的任一種或幾種；?

用于檢測丙酸桿菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:26-27中的任一種或幾種。?

6.如權利要求1所述的基因芯片，其特征在于，所述的用于檢測腈基降解菌科微生物的核酸探針，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO:29-30中的任一種或幾種。?

7.如權利要求1所述的基因芯片，其特征在于，所述的芯片載體上還固定有雜交陽性對照質控探針、雜交陰性對照質控探針、表面化學質控探針中的任一種或幾種。?

8.如權利要求7所述的基因芯片，其特征在于，所述的雜交陽性對照質控探針的核苷酸序列為SEQ?ID?NO:31。?

9.如權利要求7所述的基因芯片，其特征在于，所述的雜交陰性對照質控探針的核苷酸序列為SEQ?ID?NO:32。?

10.如權利要求7所述的基因芯片，其特征在于，所述的表面化學質控探針是一條用HEX染料標記的40個T的寡核苷酸序列。?