[發(fā)明專利]檢測蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的方法及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410146399.4 | 申請日: | 2014-04-11 |
| 公開(公告)號: | CN104099357A | 公開(公告)日: | 2014-10-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 胡榮貴;于濤;陶永輝 | 申請(專利權(quán))人: | 中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院 |
| 主分類號: | C12N15/62 | 分類號: | C12N15/62;C07K19/00;C12N15/867;C12N5/10;C40B40/02;G01N33/68;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海一平知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31266 | 代理人: | 崔佳佳;馬莉華 |
| 地址: | 200031 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 檢測 蛋白質(zhì) 穩(wěn)定性 方法 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種遺傳構(gòu)建物,其結(jié)構(gòu)如下式所示:
5’-A+B+C+D+E-3’,
其中,
A表示啟動子;
B表示由目標(biāo)蛋白和第一標(biāo)記蛋白構(gòu)成的融合蛋白的編碼序列;
C表示連接肽的編碼序列;
D表示第二標(biāo)記蛋白的編碼序列;和
E表示終止子;
其中,B和D可以互換。
2.如權(quán)利要求1所述的遺傳構(gòu)建物,其特征在于,B中5’-3’依次包含目標(biāo)蛋白的編碼序列和第一標(biāo)記蛋白的編碼序列。
3.如權(quán)利要求1所述的遺傳構(gòu)建物,其特征在于,所述連接肽選自:泛素、泛素截短體、泛素突變體及類泛素、2A短肽等;優(yōu)選泛素;最優(yōu)選K(R)飽和突變的泛素。
4.如權(quán)利要求1所述的遺傳構(gòu)建物,其特征在于,所述第一標(biāo)記蛋白和第二標(biāo)記蛋白是熒光蛋白。
5.如權(quán)利要求1所述的遺傳構(gòu)建物,其特征在于,所述目標(biāo)蛋白的編碼序列包括人類基因組文庫human?ORFeome?V5.1中所有基因。
6.一種多肽,其結(jié)構(gòu)如下式所示:
B1+C1+D1,
其中,
B1表示由目標(biāo)蛋白和第一標(biāo)記蛋白構(gòu)成的融合蛋白
C1表示連接肽;和
D1表示第二標(biāo)記蛋白;
其中B1和D1可以互換。
7.一種載體,其包含權(quán)利要求1-5中任一項所述的遺傳構(gòu)建物。
8.一種細(xì)胞,其包含權(quán)利要求1-5中任一項所述的遺傳構(gòu)建物或權(quán)利要求7所述的載體。
9.一種細(xì)胞文庫,其由權(quán)利要求8所述的細(xì)胞構(gòu)成。
10.一種檢測一個或多個目標(biāo)蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的方法,包括以下步驟:
(1)構(gòu)建權(quán)利要求9所述的細(xì)胞文庫;
(2)在所述特定條件下和對照條件下培養(yǎng)(1)所得的細(xì)胞文庫;
(3)測定所述特定條件下和對照條件下培養(yǎng)的細(xì)胞文庫中第一標(biāo)記蛋白與第二標(biāo)記蛋白之比;和
(4)通過比較所述特定條件下和對照條件下培養(yǎng)的細(xì)胞系中第一標(biāo)記蛋白與第二標(biāo)記蛋白之比得出目標(biāo)蛋白質(zhì)穩(wěn)定性是否變化的結(jié)論;或:
采用流式細(xì)胞儀技術(shù)按照第一標(biāo)記蛋白與第二標(biāo)記蛋白之比將細(xì)胞分成n個區(qū)間(n大于等于2),并通過DNA芯片技術(shù)檢測每一區(qū)間中目標(biāo)基因的各自表達(dá)量計算出目標(biāo)基因在各個區(qū)間中的分布情況,并將所述特定條件下和對照條件下培養(yǎng)的細(xì)胞系中目標(biāo)基因分布情況進(jìn)行對比,得出目標(biāo)基因所編碼的蛋白質(zhì)穩(wěn)定性是否變化的結(jié)論。
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