[發明專利]一種二倍體泥鰍微衛星家系鑒定方法及其應用有效
| 申請號: | 201410139536.1 | 申請日: | 2014-04-08 |
| 公開(公告)號: | CN103966316A | 公開(公告)日: | 2014-08-06 |
| 發明(設計)人: | 曹小娟;王衛民;白曉慧;田先暢 | 申請(專利權)人: | 華中農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 武漢開元知識產權代理有限公司 42104 | 代理人: | 徐紹新 |
| 地址: | 430070 湖*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 二倍體 泥鰍 衛星 家系 鑒定 方法 及其 應用 | ||
1.一種二倍體泥鰍微衛星家系鑒定方法,其特征在于包括如下步驟:
1)選擇健康發育良好的二倍體泥鰍作為親本進行全同胞家系繁殖,剪取每個親本的鰭條組織放于無水乙醇內,于-20℃保存備用;
2)利用醋酸銨法提取二倍體泥鰍親本和子代的基因組DNA;
3)多態性微衛星標記的篩選和引物的合成:選取8對微衛星引物,按照片段大小分為三組,第一組Mac133、Mac429、Mac37,第二組Mac477、Mac605、Mac456,第三組Ma112、Mac449,在正向引物的5’端分別用FAM、ROX、HEX三種不同的熒光基團進行修飾,用于PCR分析;
4)采用熒光PCR反應對親本及子代的DNA樣品進行PCR擴增,擴增產物按照步驟3)中所選微衛星引物分組的方法進行混合,作為上機檢測的樣品,樣品在ABI3730XL基因分析儀上進行分型,用GS-500LIZ作為內參,用GeneMapper3.5軟件讀取每個樣品的基因型;
5)采用CERVUS3.0軟件對親本基因型和子代基因型進行分析,判定子代個體的父母本,
步驟3)所述的8對微衛星引物的核苷酸序列如下所示:
Mac133F:CTGCATGCTCTTGCATAGGA R:CATTCATATTCCACCCTCTCG
Mac429F:TATGTGAGGAAGATAAGCAG R:GAATCCAGATCAAAGCAATC
Mac37 F:GCAAGTACATGCTCATCCTT R:CACCTGCATTCCTTACATCT
Mac605F:ATTCTGAAGGTCACCGTTGT R:GCAGCCGTTAATACACTGTC
Mac477F:CTGAGACTCTTTATGTCTCAC R:CTATCAAGGGAACTGAATGG
Mac456F:TCTCCTCTGACACCATCAGG R:GTACGGACACGAGTCTGGAA
Ma112 F:AGATGTACTGCACTTTCTTTA R:GAATAGCCTATATGTAAATGT
Mac449F:CCCTCCACTTCAACCCTACA R:GACCCTGCTGTCATCTCACA。
2.權利要求1所述的方法在二倍體泥鰍家系鑒定中的應用。
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