[發明專利]試劑盒及確定待測DNA樣本預定SNP位點的基因型的方法在審
| 申請號: | 201410129862.4 | 申請日: | 2014-04-01 |
| 公開(公告)號: | CN104975070A | 公開(公告)日: | 2015-10-14 |
| 發明(設計)人: | 徐謀勝;曹旸;袁亞燕;王珊 | 申請(專利權)人: | 湖北維達健基因技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志東 |
| 地址: | 430075 湖北省武*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 試劑盒 確定 dna 樣本 預定 snp 基因型 方法 | ||
1.一種試劑盒,其特征在于,包括:
第一核酸分子,所述第一核酸分子具有SEQ?ID?NO:1所示的核苷酸序列;
第二核酸分子,所述第二核酸分子具有SEQ?ID?NO:2所示的核苷酸序列;
第一探針,所述第一探針具有SEQ?ID?NO:3所示的核苷酸序列;以及
第二探針,所述第二探針具有SEQ?ID?NO:4所示的核苷酸序列,
其中,
所述探針的5’端標記有熒光報告基團,3’端標記有熒光淬滅基團,
所述第一探針與所述第二探針的熒光報告基團不同。
2.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述熒光報告基團為FAM或VIC,所述淬滅基團為MGB。
3.一種確定待測DNA樣本預定SNP位點的基因型的方法,所述預定SNP位點為VKORC1基因的rs9923231位點,其特征在于,包括:
根據Taqman探針雜交法,利用權利要求1或2所述的試劑盒,將所述待測DNA樣本進行熒光定量PCR;以及
對熒光定量PCR結果進行分析,以便確定待測樣本預定SNP位點的基因型。
4.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,利用熒光定量PCR儀,優選ABI?Stepone熒光定量PCR儀進行所述熒光定量PCR。
5.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述熒光定量PCR的反應體系為:
5重量份的Taqman?Genotyping?Master?Mix;
3.5重量份的超純水;
0.5重量份的組合物;以及
1重量份的待測DNA樣本,
其中,所述組合物由所述第一核酸分子、第二核酸分子、第一探針和第二探針組成。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述待測DNA樣本的濃度為20ng/μl。
7.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述待測DNA樣本來源于人唾液或外周血。
8.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述組合物中每種核酸分子的濃度均為18μmol/L,每種探針的濃度均為5μmol/L。
9.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述熒光定量PCR的反應程序為:
第一步:60℃下保持30秒;
第二步:95℃下保持10分鐘;
第三步:92℃下保持15秒;
第四步:60℃下保持90秒;
第五步:循環第三步第四步50次;以及
第六步:60℃下保持30秒。
10.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,利用Stepone?software?V2.1對所述熒光定量PCR結果進行分析。
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