[發明專利]檢測刺猬紫檀的專用探針、引物、基因芯片和方法

有效

• 申請號: 201410103717.9
• 申請日: 2014-03-20
• 公開（公告）號: CN103834742A
• 公開（公告）日: 2014-06-04
• 發明（設計）人: 李瑤;周佳海;張穎;壽勇明
• 申請（專利權）人: 中國科學院上海有機化學研究所;上海化學工業區醫療中心
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12M1/34;C12N15/11
• 代理公司: 上海弼興律師事務所 31283
• 代理人: 薛琦;沈利

1.檢測刺猬紫檀（Pterocarpus?erinaceus?Poir.）的專用探針，其特征在于，其是核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?NO.12所示的DNA片段，或者是核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?NO.12所示序列的反向互補序列的DNA片段。

2.檢測刺猬紫檀的基因芯片，其特征在于，其含有權利要求1所述的專用探針。

3.檢測刺猬紫檀的裝置，其特征在于，其包括如權利要求1所述的專用探針或者如權利要求2所述的DNA芯片。

4.如權利要求3所述的裝置，其特征在于，所述的裝置還包括引物對，所述的引物對中，一條引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ?ID?NO.10，另一條引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ?ID?NO.11所示。

5.如權利要求4所述的裝置，其特征在于，所述的引物上含有熒光標記。

6.檢測刺猬紫檀的引物，其特征在于，其是核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?NO.10或SEQ?ID?NO.11所示的DNA片段。

7.如權利要求6所述的引物，其特征在于，所述的引物上含有熒光標記。

8.一種檢測刺猬紫檀的方法，其特征在于，包括以下步驟：

（1）制備待測樣本的總DNA，作為模板，用含檢測標記的引物對進行PCR擴增，獲得PCR產物，所述的引物對中，一條引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ?ID?NO.10，另一條引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ?ID?NO.11所示；

（2）將專用探針結合于基因芯片的片基上，洗去未結合的探針，獲得檢測刺猬紫檀的基因芯片，所述的專用探針是核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?NO.12所示的DNA片段，或者是核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?NO.12所示序列的反向互補序列的DNA片段；

（3）在步驟（2）所得的檢測刺猬紫檀的基因芯片中加入步驟（1）所得的PCR產物，進行雜交，洗去未雜交的PCR產物；

（4）檢測步驟（3）所得的雜交后的基因芯片。

9.如權利要求8所述的方法，其特征在于，步驟（2）所述的基因芯片的片基是醛基片基，所述的探針是氨基化探針。

10.如權利要求8所述的方法，其特征在于，步驟（2）所述的基因芯片的另外的加樣孔中加入花梨木管家基因檢測探針，所述的花梨木管家基因檢測探針的序列如序列表中SEQ?ID?NO.16所示序列的核苷酸片段。