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[發明專利]檢測rs632793位點的方法及冠心病左心室收縮功能不全相關基因的檢測試劑盒在審

專利信息
申請號: 201410028096.2 申請日: 2014-01-22
公開(公告)號: CN104789645A 公開(公告)日: 2015-07-22
發明(設計)人: 金瑋;吳志俊 申請(專利權)人: 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68
代理公司: 上海元一成知識產權代理事務所(普通合伙) 31268 代理人: 吳桂琴
地址: 200025 *** 國省代碼: 上海;31
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摘要:
搜索關鍵詞: 檢測 rs632793 方法 冠心病 左心室 收縮 功能 不全 相關 基因 試劑盒
【說明書】:

技術領域

發明涉及分子生物學和醫學領域。更具體地,涉及人心房鈉肽/腦鈉肽(NPPA/NPPB?gene)的單核苷酸多態性(single?nucleotide?polymorphism,SNP)位點rs632793及其與左心室收縮功能相關性的檢測。本發明還涉及檢測這個SNP位點的方法和試劑盒。

背景技術

心力衰竭是危害全球人類健康的主要疾病之一,具有高死亡率,高發病率,高住院率和高住院費用的特點。左心室收縮功能不全(左心室射血分數<45%)是充血性心力衰竭發生的早期階段,對左心室收縮功能不全的風險預測和評估有助于延緩心力衰竭的進程,改善心力衰竭病人的生活質量和預后。冠心病是造成左心室收縮功能不全最主要的病因之一。在冠心病病人中,左心室收縮不全的臨床表現尤為嚴重,可迅速進展為心力衰竭,預后極差。目前迫切需要發現冠心病病人發生左心室收縮功能不全的風險預測指標和預后評估靶點。

隨著分子醫學的發展,左心室收縮功能不全認為是遺傳因子和環境共同作用的結果。對于環境因素的控制雖然在一定程度上可延緩左心室收縮不全的發病和預后,但對于固有的遺傳因素的認識不足極大地妨礙了對左心室收縮功能不全的研究和判斷。

目前研究表明左心室收縮功能不全及其隨后心力衰竭的發生是由一系列神經-體液因素參與。其中,利鈉肽家族扮演重要角色。利鈉肽家族是一組由心肌細胞分泌的激素,具有相似的化學結構和生理學效應,主要包括調節血壓,抗心肌肥厚,抗心力衰竭等作用。De?Bold等通過電子顯微鏡首次發現心房肌細胞分泌的顆粒中包含心房利鈉肽(ANP)[de?Bold?AJ,Borenstein?HB,Veress?AT,et?al.A?rapid?and?potent?natriuretic?response?to?intravenous?injection?of?atrial?myocardial?extract?in?rats.Life?Sci,1981,28(1):89-94.]。隨后另一利鈉肽家族成員-腦鈉肽(BNP)在豬腦中發現。ANP和BNP的作用相似,基因位置毗鄰,形成NPPA-NPPB基因座。NPPA基因(GeneID4878)缺失小鼠血壓顯著升高,心肌肥厚增加。NPPB基因(GeneID4879)缺失小鼠心肌廣泛纖維化。BNP與其終末端結構(NT-proBNP)升高被公認為左心室功能障礙和心力衰竭的預測指標。

盡管如此,對于利鈉肽家族是否對冠心病病人發生左心室收縮功能不全的風險評估目前尚無定論,這正是當前研究左心室收縮功能不全的主要方向之一。

發明內容

本發明的目的是提供一種NPPA/NPPB基因座啟動子的單核苷酸多態性基因型的方法。

本發明的另一個目的是提供一種NPPA/NPPB基因座啟動子的單核苷酸多態性基因型的檢測試劑盒。

本發明的再一個目的是提供一種NPPA/NPPB基因座啟動子的單核苷酸多態性基因型的檢測試劑盒的應用。根據NPPA/NPPB基因座啟動子的單核苷酸多態性基因型的分型結果,可以用于輔助預測或者判斷冠心病患者的左心室收縮功能不全的易感性。

本發明提供了一種檢測NPPA/NPPB基因座啟動子的單核苷酸多態性基因型的方法,該方法包括步驟:

用NPPA/NPPB基因座啟動子的特異性引物擴增樣品的基因組DNA,得到擴增產物;

檢測(a)所得的擴增產物中單核苷酸多態性位點rs632793的基因。

所述的單核苷酸多態性的位點是rs632793。

rs632793位于NPPA/NPPB基因座啟動子中,片段重疊群contig:NT_021937.18位置6448044A/G。

其中,脫氧核糖核酸(DNA)序列編號:rs632793位置基于SEQ?ID?NO:1/6;擴增產物基于SEQ?ID?NO:6/6。

所述的NPPA/NPPB基因座啟動子的特異性引物的序列如SEQ?ID?NO2和SEQ?ID?NO3所示。

在本發明的一個實施例中,擴增反應時,退火/延伸的溫度為60℃。更好的,在擴增反應的標準反應中,退火和延伸的步驟均為:60℃,30秒。

所述的擴增產物的序列如SEQ?ID?NO6所示。

所述的方法包括利用與位點rs632793結合的探針檢測NPPA/NPPB基因座啟動子的單核苷酸多態性基因型。

第二方面,本發明還提供了一種針對冠心病病人左心室收縮功能不全易感基因的檢測試劑盒,它包括特異性擴增NPPA/NPPB基因座啟動子的引物。

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