[發明專利]一種檢測柑桔黃脈病毒的引物對及檢測方法無效
| 申請號: | 201410025175.8 | 申請日: | 2014-01-20 |
| 公開(公告)號: | CN103757135A | 公開(公告)日: | 2014-04-30 |
| 發明(設計)人: | 陳洪明;李中安;王雪峰;周彥;唐科志;周常勇 | 申請(專利權)人: | 中國農業科學院柑桔研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海光華專利事務所 31219 | 代理人: | 余明偉 |
| 地址: | 400712 重*** | 國省代碼: | 重慶;85 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 柑桔 病毒 引物 方法 | ||
技術領域
本發明涉及病毒檢測技術領域,特別是涉及一種柑桔黃脈病毒的引物對及快速檢測方法。
背景技術
柑桔黃脈病(Citrus?yellow?vein?clearing?disease,CYVCD),也稱檸檬黃脈病(Yellow?vein?clearing?of?Lemon),是由柑桔黃脈病毒(Citrus?yellow?vein?clearing?virus,CYVCV)引起的。該病是Bové(1989)在巴基斯坦調查發現后命名的,它是威脅檸檬生產的重要病害之一。主要癥狀表現為葉片側脈及側脈附近脈明、黃化,對光看更為明顯,葉背可見側脈處水浸狀,部分葉片皺縮、反卷或船形葉,嫩葉癥狀表現明顯,到老葉癥狀也不消失。主要導致光合作用降低、樹勢減弱、減產20%左右。檸檬黃脈病目前主要發生在印度、巴基斯坦、土耳其等國家。近年在我國云南瑞麗、重慶也發生類似癥狀,是我國柑桔上的新發病害。
到目前為止,世界上對該病害的研究較少,大都停留在生物學特性研究方面,本人近幾年研究結果表明該病害具有嫁接傳染性,對所有檸檬、酸橙品種都具有嫁接傳染性并具典型癥狀,對甜橙、寬皮柑桔也具有侵染性,但癥狀不明顯;能侵染辣椒和豇豆;柑桔黃脈病最適宜發病溫度為18~24℃,柑桔黃脈病病毒微粒為13~15×400~1000nm聯合絲狀,通過熱處理結合莖尖嫁接脫毒方法能有效脫除該病毒。這些研究結果與國外研究報道的相關結果相同。
但由于通過指示植物鑒定具有時間長,工作量大,不利于田間樣品的大量檢測。且到目前為止,國內尚無RT-PCR快速檢測柑桔黃脈病毒的方法報道。
發明內容
本發明的目的是建立一種柑桔黃脈病毒快速檢測方法。該方法具有速度快、成本低、重復性好、穩定性高、操作性強等特點,適合大規模、高通量的樣品分析,適用于田間樣品檢測、柑桔黃脈病流行監控、脫毒苗木鑒定等多種用途。
本發明的目的是這樣實現的:
本發明目的之一,根據已報道的柑桔黃脈病毒全序列設計特異性引物對:
上游引物:5’-TACCGCAGCTATCCATTTCC-3’
下游引物:5’-GCAGAAATCCCGAACCACTA-3’
總核酸提取及(RT)-PCR擴增所需試劑如下:
RNAiso?Plus1ml,氯仿200μL,異丙醇,75%乙醇,DEPC水,2×Buffer液5μL,MgSO40.3μL,RT/Taq酶0.2μL,正反引物各0.2μL,滅菌去離子水2.1μL。
(RT)-PCR擴增條件為:42℃,30min;94℃,2min;94℃,30S,55℃,30S,72℃,40S,40個循環;72℃,5min。
本發明的目的還在于提供一種柑桔黃脈病毒檢測的試劑盒,包括下列引物對:
上游引物:5’-TACCGCAGCTATCCATTTCC-3’
下游引物:5’-GCAGAAATCCCGAACCACTA-3’。
本發明的目的還在于提供一種快速檢測柑桔黃脈病毒的RT-PCR的檢測方法,包括如下步驟:提取柑桔樣品總核酸,設計特異性引物,對待測樣品進行RT-PCR擴增,最后電泳鑒定:
所述RT-PCR擴增所需試劑如下:
RNAiso?Plus1ml,氯仿200μL,異丙醇,75%乙醇,DEPC水,
2×Buffer液5μL,MgSO40.3μL,RT/Taq酶0.2μL,正反引物各0.2μL,滅菌去離子水2.1μL;
RT-PCR擴增條件為:程序為42℃,30min;94℃,2min;94℃,30S,55℃,30S,72℃,40S,40個循環;72℃,5min。
優選的,所述提取樣品總核酸,樣品主要取春、秋梢嫩葉葉脈及附近組織。
所述電泳鑒定得到的特異性片段大小為612bp。
本發明具體按如下步驟進行:
1、總核酸提取:
(1)取樣、研磨:
由于CYVCV癥狀主要表現春季和秋季的葉片上,尤其在嫩葉上,故采樣嫩葉葉脈及附近組織10-15mg裝于無菌eppendorf管,液氮研磨;
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