[發明專利]PKCα-siRNA質粒載體的構建、篩選方法及應用在審
| 申請號: | 201410011031.7 | 申請日: | 2014-01-09 |
| 公開(公告)號: | CN103773789A | 公開(公告)日: | 2014-05-07 |
| 發明(設計)人: | 王金華;趙麗君 | 申請(專利權)人: | 江蘇省腫瘤防治研究所 |
| 主分類號: | C12N15/66 | 分類號: | C12N15/66;C12Q1/68;G01N33/68 |
| 代理公司: | 北京紐樂康知識產權代理事務所(普通合伙) 11210 | 代理人: | 張朝元 |
| 地址: | 210000 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | pkc sirna 質粒 載體 構建 篩選 方法 應用 | ||
1.一種PKCα-siRNA質粒載體的構建及其篩選方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)設計及合成靶向PKCα的siRNA,進一步包括以下步驟:
1.1)根據基因庫PKCα基因序列篩選出候選序列;
1.2)根據RNAi目標序列的選取原則優化siRNA序列;
1.3)確定靶向PKC-α的siRNA的目標序列;
2)構建PKC-α?siRNA的重組質粒載體,進一步包括以下步驟:
2.1)退火連接單鏈目的基因片段;
2.2)Eco31I酶切質粒pEGFP-iLenti;
2.3)1%瓊脂糖凝膠回收酶切線性空載體;
2.4)連接線性化質粒載體;
2.5)重組質粒轉化大腸桿菌感受態細胞及擴增;
2.6)純化重組質粒。
2.根據權利要求1所述的PKCα-siRNA質粒載體的構建及其篩選方法,其特征在于:步驟1.2)根據RNAi目標序列的選取原則優化siRNA序列,進一步包括以下步驟:
1.2.1)從轉錄本的AUG起始密碼開始,尋找AA二連序列,記下其3’端的19個堿基序列,作為潛在的siRNA靶位點;
1.2.2)利用BLAST軟件將候選序列和相應的基因組數據庫進行比較,排除和其他編碼序列或基因表達序列標簽同源的候選序列;
1.2.3)選出合適的目標序列。
3.根據權利要求2所述的PKCα-siRNA質粒載體的構建及其篩選方法,其特征在于:步驟1.3)中確定的目標序列為:
5'-492?AAAGGCTGAGGTTGCTGAT-3',
5'-746?GAACAACAAGGAATGACTT-3',
5'-1114?AAGGATGTGGTGATTCAGGAT-3',
5'-1676?AATCCTTGTCCAAGGAGGCTG-3'。
4.權利要求1-3任一項所述的構建及其篩選方法獲得的PKCα-siRNA?492質粒載體逆轉腫瘤耐藥表型的用途。
5.權利要求1-3任一項所述的構建及其篩選方法方法獲得的PKCα-siRNA?492質粒載體提高腫瘤耐藥細胞株的藥物敏感性的用途。
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