[發明專利]一種兩核苷酸實時合成測序圖譜鑒定微生物種群的方法有效
| 申請號: | 201410009116.1 | 申請日: | 2014-01-09 |
| 公開(公告)號: | CN103740824A | 公開(公告)日: | 2014-04-23 |
| 發明(設計)人: | 肖鵬峰;浦丹 | 申請(專利權)人: | 東南大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/32;C12R1/33 |
| 代理公司: | 江蘇永衡昭輝律師事務所 32250 | 代理人: | 王斌 |
| 地址: | 210096*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 核苷酸 實時 合成 圖譜 鑒定 微生物 種群 方法 | ||
1.一種兩核苷酸循環實時合成測序圖譜鑒定微生物種群的方法,其特征在于,通過對微生物特定可變區的待測核苷酸序列進行兩核苷酸循環的測序反應,由測序反應所得到的測序圖譜確定微生物具體的菌株;所述的兩核苷酸為dATPaS、dCTP、dTTP?、dGTP中的兩種不同的核苷酸,所述兩核苷酸循環測序反應指從(dATPaS+dCTP)/(dGTP+dTTP)、(dATPaS+dGTP)/(dCTP+dTTP)、?(dATPaS+dTTP)/(dCTP+dGTP)三組中選擇其中一組進行兩核苷酸循環測序反應,所述的測序反應得到的測序圖譜包括參與合成反應的核苷酸種類(峰的類型),以及合成核苷酸的數目(峰的高度或者信號強度)。
2.根據權利要求1所述的一種兩核苷酸循環實時合成測序圖譜鑒定微生物種群的方法,其特征在于,所述的微生物特定可變區的待測核酸序列先通過PCR擴增后再進行兩核苷酸循環實時合成測序。
3.根據權利要求1所述的一種兩核苷酸循環實時合成測序圖譜鑒定微生物種群的方法,其特征在于,所述測序圖譜的特征包括峰的類型、峰的高度,以及峰的排列形式構成的全部信息。
4.根據權利要求1所述的一種兩核苷酸循環實時合成測序圖譜鑒定微生物種群的方法,其特征在于,dNTPs合成實時釋放相同的檢測分子,其檢測分子是化學發光檢測的焦磷酸鹽,電化學檢測的氫離子或者光學檢測的熒光信號。
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