[發明專利]用于預測從巴雷特食管到高度發育異常食管腺癌的進展的方法

在審

• 申請號: 201380038453.7
• 申請日: 2013-05-16
• 公開（公告）號: CN104487595A
• 公開（公告）日: 2015-04-01
• 發明（設計）人: 麗貝卡·菲茨杰拉德;伊麗莎白·伯德-利伯曼
• 申請（專利權）人: 醫藥研究委員會
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;G01N33/574
• 代理公司: 隆天國際知識產權代理有限公司 72003
• 代理人: 吳小瑛;王芝艷

技術領域

本發明涉及預測從巴雷特食管(Barrett’s?Esophagus)到高度發育異常或食管腺癌的進展。特別地，本發明涉及用于輔助預測此進展的可能性的方法。

背景技術

胃食管反流可導致巴雷特食管(BE)，其中末端食道的鱗狀上皮被替換成柱狀上皮。3％的反流癥狀的內窺鏡檢查患者中發現了BE并且在所有接受內窺鏡檢查的患者中，1％的患者發現了BE(1，2)。BE的重要性在于其通過化生-發育異常-腺癌的續發事件進展至食管腺癌(EAC)的潛在可能性。EAC繼續具有糟糕的預后，其五年整體存活率小于20％(3)。

基于最近的meta分析(4-6)和基于大量人群的研究，從非發育異常BE(NDBE)進展至EAC的速率在每年0.2-0.5％的區間內。這表明在一般人群中存在小但顯著增長的相對風險。輔導單個患者是困難的，這是因為大多數患有NDBE的患者不會進展至EAC，并且目前，預測哪個患者具有風險的能力還十分有限(4)。這是本領域存在的問題。

用以監測從NDBE進展至發育異常或EAC的內窺鏡監測計劃是非常昂貴的，并且需要高度熟練的內窺鏡醫師。此外，其存在成本效益的問題，且其在降低癌癥死亡率方面的價值還未得到證明。

越來越多的證據表明，大多數產生于BE的EAC的發生與染色體不穩定相關，其特征在于染色體數目的廣泛不平衡(非整倍體/四倍體)和雜合性缺失。這些核型異常通常與在與癌癥誘發和進展相關的特定腫瘤抑制基因和致癌基因中的突變的積累相關(7)。早期檢測研究網絡(EDRN)已確定一個通路，在將假定的生物標記物用于常規臨床使用之前，必須通過此通路來驗證該假定的生物標記物(8)。已經在代表性的2期和3期研究中鑒定出幾種具有臨床用于BE的潛力的生物標記物。先前已證實細胞周期蛋白A(增殖的細胞的比例的標志物)的表面表達與BE內的發育異常程度相關，并且可以使用組織化學進行評估(9)。先前通過流式細胞儀測量的DNA含量異常(非整倍體/四倍體)(10、11)也可以使用圖像細胞計數DNA分析(DNA拷貝數)(可應用于石蠟切片)來進行精確的評估(12)。腫瘤抑制基因p53基因的失活已被鑒定為EAC進展中的關鍵事件，并且p53的雙等位基因失活與EAC的后續進展相關(13)。

聚糖表達的協調變化已被證實發生于EAC的進展中。基因表達分析表明，大多數在進展至EAC的過程中最有助于聚糖通路的富集的基因在Lewis抗原的合成中起作用，已知Lewis抗原在其它癌癥中改變了(16-18)。Lewis抗原的3期研究(使用免疫組織化學)確認了sLe^a(也稱為CA19-9)和Le^x(CD15)的表達與BE內的發育異常程度相關。也通過凝集素組織化學證實了凝集素(特異性聚糖結合蛋白)小麥胚芽凝集素(WGA)和米曲霉(Aspergillus?oryzae)凝集素(AOL)在進展至EAC的過程中具有高度顯著降低的結合力。

在BE診斷中個體化進展風險的目標標記物將允許臨床醫生對具有高風險的患者進行靶向干預如內窺鏡檢查或微創治療，而那些具有低風險的患者可以安心并避免了不必要且昂貴的后續跟進。但是，目前沒有這樣的個體化的風險評估，并且并不知曉從BE到EAC的進展中的可靠的分子預測物，這是本領域中的問題。

本發明旨在克服與現有技術相關的問題。

發明內容

從巴雷特食管(BE)進展至食管腺癌(EAC)的風險較低且難以預測。現有技術中不存在精確的風險預測工具。

本發明人考慮了通過WGA檢測的包括sLe^a、Le^x、唾液酸殘基和通過AOL檢測的Fucα1-6GlcNAc殘基的寬范圍的候選標記物，以預測BE中進展至EAC的進程。此外，早期分子變化(其甚至早于發育異常的出現就被發現)被認為是進展至EAC的風險的可能的生物標記物。但是本領域中沒有教導，任何此類標記物具有任何作為進展至EAC的關鍵參數的預測價值。通過設計一個研究來評估候選生物標記物在預測BE中腫瘤(neoplastic)進展過程中的性能以及創制生物標記物組(panel)作為風險分級工具，本發明人解決了這些問題。

本發明人公開了基于3期人群的研究，其揭示了用于巴雷特食管的新的風險分級生物標記物組。作為這項研究的結果，本發明人已經能夠獲得生物標記物的小且集中(focused)的組，其提供了對于進展至EAC而言具有穩健統計意義的預測工具。這種預測進展至EAC的新的能力本身就是顯著的進步。此外，使用這一工具能進一步利于如優化監測和干預機制。