[發(fā)明專利]同時(shí)檢測(cè)尖孢鐮刀菌古巴?;?號(hào)與4號(hào)小種的LAMP方法無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201310737490.9 | 申請(qǐng)日: | 2013-12-30 |
| 公開(公告)號(hào): | CN103773854A | 公開(公告)日: | 2014-05-07 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 楊雷亮;孫麗霞;陳定虎;邱德義;王章根;管維 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中華人民共和國(guó)中山出入境檢驗(yàn)檢疫局 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/77 |
| 代理公司: | 南京理工大學(xué)專利中心 32203 | 代理人: | 朱顯國(guó) |
| 地址: | 528403*** | 國(guó)省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 同時(shí) 檢測(cè) 鐮刀 古巴 ?;?/a> 號(hào)小種 lamp 方法 | ||
1.一種同時(shí)檢測(cè)尖孢鐮刀菌古巴?;?號(hào)與4號(hào)小種的LAMP方法,其特征在于:所述檢測(cè)方法包括LAMP?引物的設(shè)計(jì)與合成、模板DNA的提取、LAMP?擴(kuò)增體系建立,LAMP?擴(kuò)增方法,所述的LAMP?擴(kuò)增方法反應(yīng)溫度為63℃左右、反應(yīng)在90min?內(nèi)完成擴(kuò)增,引物包括外引物、內(nèi)引物;
所述的外引物是F3?和B3?;
所述的內(nèi)引物是FIP?和BIP;
所述引物序列自5'?端到3'?端如下:
F3:TTGCACCAGAAACGGTAT
B3:TTGCACCAGAAACGGTAT
FIP:TATCAGCTTGCTCCCCTGC-CGATGACCTCAATAACAAAACC
BIP:AGAGGCATAATTGGTTGTAGTGC-TTTTTTGGTGGCCCATGT。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)方法,其特征在于:所述模板DNA提取指植物或菌體組織DNA的提取。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)方法,其特征在于:所述LAMP?擴(kuò)增體系建立是采用水溶液配置,體系總體積25μL,其中包括:
模板DNA???2μL
2×U-LAMP?MIX?????17μL
F3???5uM,?1μL
B3??5uM,?1μL?
FIP?40uM,?1μL
BIP?40uM,?1μL
Bst?DNA?酶??????????8?U/μL,?1μL
熒光染料??1μL。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)方法,其特征在于:所述LAMP擴(kuò)增方法采用實(shí)時(shí)熒光PCR儀,將按照LAMP擴(kuò)增體系配制好的試劑加入反應(yīng)器中,63℃左右反應(yīng)1小時(shí),共分為40個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)1分鐘30秒,每個(gè)循環(huán)結(jié)束時(shí)收集熒光。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)方法,其特征在于:所述LAMP擴(kuò)增方法采用普通水浴鍋或金屬浴完成,將按照LAMP擴(kuò)增體系配制好的試劑加入PE管中,放入63℃左右水浴鍋中保溫90min,然后取出放入另一80℃水浴鍋中保溫10?min后,取出。
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