[發明專利]大豆南方莖潰瘍病菌的檢測靶標及其LAMP引物組合物和應用有效
| 申請號: | 201310686657.3 | 申請日: | 2013-12-13 |
| 公開(公告)號: | CN103710440A | 公開(公告)日: | 2014-04-09 |
| 發明(設計)人: | 鄭小波;沈浩;戴婷婷;王源超;張海峰 | 申請(專利權)人: | 南京農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京天華專利代理有限責任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;徐冬濤 |
| 地址: | 211225 江蘇省南京市溧*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 大豆 南方 潰瘍 病菌 檢測 靶標 及其 lamp 引物 組合 應用 | ||
1.大豆南方莖潰瘍病菌的檢測靶標序列Tef1-α,其特征在于核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。
2.SEQ?ID?NO.1所示的大豆南方莖潰瘍病菌的檢測靶標序列Tef1-α在檢測或鑒定大豆南方莖潰瘍病菌中的應用。
3.針對權利要求1所述的大豆南方莖潰瘍病菌的檢測靶標序列Tef1-α設計的特異性的LAMP引物組合物,其特征在于包括正向內引物FIP如SEQ?ID?NO.2所示,反向內引物BIP如SEQ?ID?NO.3所示,正向外引物F3如SEQ?ID?NO.4所示,反向外引物B3如SEQ?ID?NO.5所示。
4.權利要求3所述的特異性的LAMP引物組合物在制備檢測或鑒定大豆南方莖潰瘍病菌的試劑中的應用。
5.一種用于檢測大大豆南方莖潰瘍病菌的LAMP檢測試劑盒,其特征在于包含權利要求3所述的特異性的LAMP引物組合物。
6.根據權利要求5所述的用于檢測大豆南方莖潰瘍病菌的LAMP檢測試劑盒,其特征在于所述的試劑盒包含:由20mM正向內引物FIP、20mM反向內引物BIP,10mM正向外引物F3、10mM反向外引物B3,10%10xThermoPol?Reaction?Buffer、50mM?MgSO4、10mMdNTP?Mixture、5M甜菜堿、8000U/mLBst?DNA?Polymerase?Large?fragment及超純水組成的檢測溶液。
7.一種檢測大豆南方莖潰瘍病菌的方法,其特征在于提取待檢微生物的DNA,以提取的DNA為模板,利用權利要求3所述的特異性的LAMP引物組合物進行LAMP擴增反應;擴增產物加入SYBR?GREENⅠ染料,在常光和/或紫外光下檢測結果,如果反應產物在常光下變顯黃色、在紫外光下產生強烈熒光,則表示存在大豆南方莖潰瘍病菌,在常光下顯橙色、紫外光下無熒光產生則表示不含該病菌。
8.根據權利要求7所述的檢測大豆南方莖潰瘍病菌的方法,其特征在于提取待檢微生物的DNA,取3μl?DNA溶液,加入19.5μl權利要求6所述的檢測溶液和2.5μl滅菌去離子水進行LAMP反應,反應程序為:64℃70min;增產物加入SYBR?GREENⅠ染料,在紫外光下檢測結果,如果反應產物產生強烈熒光,則表示存在大豆南方莖潰瘍病菌,無熒光產生則表示不含該病菌。
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