[發(fā)明專利]一種檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的方法及試劑盒無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310659976.5 | 申請日: | 2013-12-09 |
| 公開(公告)號: | CN103642920A | 公開(公告)日: | 2014-03-19 |
| 發(fā)明(設計)人: | 曾靈;蔣建新;杜娟;王海燕;顧瑋;岳彩黎 | 申請(專利權(quán))人: | 中國人民解放軍第三軍醫(yī)大學第三附屬醫(yī)院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京元本知識產(chǎn)權(quán)代理事務所 11308 | 代理人: | 黎昌莉 |
| 地址: | 400042 重*** | 國省代碼: | 重慶;85 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 檢測 rage 家族 基因 標簽 單核 多態(tài)性 方法 試劑盒 | ||
1.一種檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的方法,其特征在于,具體包括以下步驟:
1)特異性引物的設計
根據(jù)被證實的RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點,設計特異性擴增引物和測序引物,其中,所述特異性擴增引物中的一條用生物素標記;
2)PCR擴增
以待測標本的DNA為模板,用步驟1)所述的特異性擴增引物進行PCR擴增,得PCR擴增物;
3)焦磷酸測序
將步驟2)所得PCR擴增物采用堿變性使其分開成單鏈,取其中被生物素標記的單鏈PCR擴增產(chǎn)物純化后,與步驟1)所述測序引物進行雜交反應,并分析結(jié)果以判斷所述待測標本的RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點是否具備多態(tài)性。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的方法,其特征在于:步驟1)中,所述的RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點包括:rs1800625和rs2070600位點。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的方法,其特征在于:
所述rs1800625位點的上游擴增引物的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示,下游擴增引物的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:2所示,測序引物如SEQ?ID?NO:3所示;所述rs2070600位點的上游擴增引物的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:4所示,下游擴增引物的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:5所示,測序引物如SEQ?ID?NO:6所示。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的方法,其特征在于:所述步驟2)中,所述PCR擴增為所述rs1800625位點和所述rs2070600位點組合進行雙重PCR擴增。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的方法,其特征在于:所述步驟3)中,對所述rs1800625位點和所述rs2070600位點組合進行雙重焦磷酸測序。
6.用于檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒包括RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的特異性擴增引物,RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的焦磷酸測序引物,以及PCR反應液、PCR產(chǎn)物篩選液、焦磷酸測序反應液。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的用于檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的試劑盒,其特征在于,所述特異性擴增引物如SEQ?ID?NO:1-2所示,和/或如SEQ?ID?NO:4-5所示。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的用于檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的試劑盒,其特征在于,所述測序引物如SEQ?ID?NO:3所示,和/或如SEQ?ID?NO:6所示。
9.根據(jù)權(quán)利要求6所述的用于檢測RAGE家族基因標簽單核甘酸多態(tài)性位點的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括標記所述特異性擴增引物的生物素。
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