[發(fā)明專利]一種菜豆普通花葉病毒的逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫檢測(cè)方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201310643147.8 | 申請(qǐng)日: | 2013-12-03 |
| 公開(公告)號(hào): | CN103667528A | 公開(公告)日: | 2014-03-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 竺曉平;李剛;趙黎明 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 山東農(nóng)業(yè)大學(xué) |
| 主分類號(hào): | C12Q1/70 | 分類號(hào): | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94 |
| 代理公司: | 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245 | 代理人: | 關(guān)暢;陳曉慶 |
| 地址: | 271000 *** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 菜豆 普通 花葉 病毒 逆轉(zhuǎn)錄 環(huán)介導(dǎo) 等溫 檢測(cè) 方法 | ||
1.一組引物,由如下(1)-(4)所示的DNA分子組成:
(1)SEQ?ID?No.1所示的DNA分子;
(2)SEQ?ID?No.2所示的DNA分子;
(3)SEQ?ID?No.3所示的DNA分子;
(4)SEQ?ID?No.4所示的DNA分子。
2.一種檢測(cè)菜豆普通花葉病毒的試劑盒,該試劑盒包含權(quán)利要求1所述的引物、反轉(zhuǎn)錄酶和Bst?DNA聚合酶;
所述反轉(zhuǎn)錄酶為M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶或AMV反轉(zhuǎn)錄酶。
3.一種檢測(cè)菜豆普通花葉病毒的方法,該方法是以待測(cè)樣品的總RNA為模板,以權(quán)利要求1所述的引物為引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增,若得到逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增產(chǎn)物,則所述待測(cè)樣品中候選含有菜豆普通花葉病毒,若得不到逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增產(chǎn)物,則所述待測(cè)樣品中候選不含有菜豆普通花葉病毒。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于:所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增產(chǎn)物是否得到的判斷方法為如下(1)和/或(2):
(1)將逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,具有彌散狀核酸電泳條帶的待測(cè)樣品為含有菜豆普通花葉病毒的樣品,不具有彌散狀核酸電泳條帶的待測(cè)樣品為不含有菜豆普通花葉病毒的樣品;
(2)將逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增反應(yīng)產(chǎn)物與SYBR?Green?I反應(yīng)得反應(yīng)液,反應(yīng)液呈翠綠色的待測(cè)樣品候選為含有菜豆普通花葉病毒的樣品,反應(yīng)液呈橙色的待測(cè)樣品候選為不含有菜豆普通花葉病毒的樣品。
5.根據(jù)權(quán)利要求3或4所述的方法,其特征在于:所述權(quán)利要求1所述的引物中SEQ?ID?No.1所示的DNA分子和SEQ?ID?No.2所示的DNA分子為外引物,SEQ?ID?No.3所示的DNA分子和SEQ?ID?No.4所示的DNA分子為內(nèi)引物;
所述外引物中SEQ?ID?No.1所示的DNA分子與SEQ?ID?No.2所示的DNA分子在所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增中的摩爾濃度比為1:1;
所述內(nèi)引物中SEQ?ID?No.3所示的DNA分子與SEQ?ID?No.4所示的DNA分子在所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增中的摩爾濃度比為1:1。
所述外引物與所述內(nèi)引物在所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增中的摩爾濃度比具體為1:5。
6.根據(jù)權(quán)利要求3-5任一所述的方法,其特征在于:所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增中的反應(yīng)溫度為62℃。
7.根據(jù)權(quán)利要求3-6任一所述的方法,其特征在于:所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增中的鎂離子濃度為5mM。
8.根據(jù)權(quán)利要求3-7任一所述的方法,其特征在于:所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增的體系如下:
10×Thermopol?buffer2.5μL,SEQ?ID?No.1所示的DNA分子0.2μM,SEQ?ID?No.2所示的DNA分子0.2μM,SEQ?ID?No.3所示的DNA分子1.0μM,SEQ?ID?No.4所示的DNA分子1.0μM,dNTPs1.0mM,MgCl25mM,反轉(zhuǎn)錄酶200U,Bst?DNA聚合酶12U,所述待測(cè)樣品的總RNA40ng,余量為ddH2O,體系25μL;
所述10×Thermopol?buffer購自紐英倫生物技術(shù)(北京)有限公司,產(chǎn)品目錄號(hào)為M0275;
所述反轉(zhuǎn)錄酶為M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶或AMV反轉(zhuǎn)錄酶;
所述Bst?DNA聚合酶的商品名稱為Bst?DNApolymerase,購自紐英倫生物技術(shù)(北京)有限公司,產(chǎn)品目錄號(hào)為M0275;
所述逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增的反應(yīng)條件為:62℃等溫1h;80℃5min。
9.根據(jù)權(quán)利要求3-8任一所述的方法,其特征在于:所述M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶購自TaKaRa公司,產(chǎn)品目錄號(hào)為2641A;
所述樣品具體為待測(cè)樣品的葉片。
10.權(quán)利要求1所述的引物在檢測(cè)菜豆普通花葉病毒中的應(yīng)用;
和/或,
權(quán)利要求2所述的試劑盒在檢測(cè)菜豆普通花葉病毒中的應(yīng)用。
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