[發(fā)明專利]環(huán)脂肽抗生素羅克霉素生物合成相關(guān)的基因簇

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201310586700.9
• 申請日: 2013-11-21
• 公開（公告）號: CN104651380A
• 公開（公告）日: 2015-05-27
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 羅楚平;郭俊堯;王曉宇;陳志誼
• 申請（專利權(quán)）人: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
• 主分類號: C12N15/52
• 分類號: C12N15/52;C12N9/00;C12R1/125
• 代理公司: 無
• 代理人: 無

1.一種具有廣譜抗菌，特別是抗病毒活性的環(huán)脂肽抗生素-羅克霉素的生物合成基因，其特征在于，所述的基因選自下組：?

1)LocD基因：?

LocD的核酸序列為SEQ?ID?NO：1所示的核苷酸序列第7565-11446個堿基，長度為3882個堿基，編碼1293個氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：4所示；?

2)LocA基因?

LocA的核酸序列為SEQ?NO：1所示的核苷酸序列第11667-18644個堿基，長度為6978個堿基，編碼2325個氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：5所示；?

3)LocB基因?

LocB的核酸序列為SEQ?NO：1所示的核苷酸序列第18726-30332個堿基，長度為11607個堿基，編碼3868個氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：6所示；?

4)LocC基因：?

LocC的核酸序列為SEQ?NO：1所示的核苷酸序列第30402-36782個堿基，長度為6381個堿基，編碼2126個氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：7所示。?

2.如權(quán)利要求1所述的具有廣譜抗菌，特別是抗病毒活性的環(huán)脂肽抗生素-羅克霉素的生物合成基因所編碼的蛋白，其特征在于，所述的蛋白選自下組：?

1)LocD基因編碼的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：4所示；?

2)LocA基因編碼的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：5所示；?

3)LocB基因編碼的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：6所示；和?

4)LocC基因編碼的蛋白，其氨基酸序列如SEQ?ID?NO：7所示。?

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的環(huán)脂肽羅克霉素的生物合成基因所編碼的蛋白的用途，其特征在于，所述的蛋白是LocD基因、LocA基因、LocB基因和LocC基因編碼的蛋白，羅克霉素合成基因簇及編碼蛋白所含功能結(jié)構(gòu)域詳細(xì)描述如下：?

1)LocD基因編碼的蛋白含有乙酰CoA連接酶結(jié)構(gòu)域(acyl-CoA?ligase?domain，ACS)，乙酰載體蛋白結(jié)構(gòu)域(acyl?carrier?protein?domain，PCP)，和β酮乙酰合成酶結(jié)構(gòu)域(β-keto?acyl?synthetase?domain，KAS)?

2)LocA基因編碼的蛋白含有一個氨基酸殘基延伸模塊，由3個PCP結(jié)構(gòu)域，3個縮合結(jié)構(gòu)域(condensation?domain，C)；1個腺苷?；Y(jié)構(gòu)域(adenylation?domain，A)組成；?

3)LocB基因編碼的蛋白含有3個氨基酸殘基延伸模塊，由3個PCP結(jié)構(gòu)域，3個C結(jié)構(gòu)域和3個A結(jié)構(gòu)域組成；?

4)LocC基因編碼的蛋白含有2個氨基酸殘基延伸模塊和一個脂肽環(huán)化釋放模塊，由2個PCP結(jié)構(gòu)域，1個C結(jié)構(gòu)域，2個A結(jié)構(gòu)域和1個硫脂酶結(jié)構(gòu)域(Thioesterase?domain，TE)組成；?

它們用于催化合成羅克霉素以下反應(yīng)：激活脂肪酸，脂肪酸連接至蘇氨酸殘基，然后選擇性的將不同的氨基酸殘基整合到脂肽鏈骨架，該過程中LocB基因編碼的蛋白被重復(fù)使用，形成一條含有脂肪酸和9個氨基酸殘基組成的肽鏈，最終肽鏈?zhǔn)孜蚕噙B環(huán)化形成成熟的脂肽抗生素羅克霉素。?