[發(fā)明專利]用于檢測人肝癌細(xì)胞標(biāo)志物的引物和探針及其檢測試劑盒有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310551809.9 | 申請日: | 2013-11-07 |
| 公開(公告)號: | CN103540679A | 公開(公告)日: | 2014-01-29 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 方向東;蔡侃;李澤夏;程華;杜夏 | 申請(專利權(quán))人: | 中國科學(xué)院北京基因組研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
| 地址: | 101300 北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 檢測 肝癌 細(xì)胞 標(biāo)志 引物 探針 及其 試劑盒 | ||
1.用于檢測人肝癌細(xì)胞標(biāo)志物的引物和探針,其特征在于,包括用于檢測磷脂酰肌醇蛋白聚糖cDNA的引物和探針以及用于檢測甲胎蛋白cDNA的引物和探針:
用于檢測磷脂酰肌醇蛋白聚糖cDNA的引物和探針為:
上游引物GPC3F:5’-CTGTCCCTTGAAGAACTTGTGA-3’
下游引物GPC3R:5’-TTGAGAATGGGCACATAACTTG-3’
探針GPC3Probe:5’-FAM-ACAGAATCTATGACATGGAGAACGT-TAMRA-3’;
用于檢測甲胎蛋白cDNA的引物和探針為:
上游引物AFP?F:5’-GACAGCCTCAAGTTGTTCCTC-3’
下游引物AFP?R:5’-GGCTGACATTATTATCGGACAC-3’
探針AFP?Probe:5’-HEX-TATCAGACATGAAATGACTCCAGTAA-TAMRA-3’。
2.含有權(quán)利要求1所述引物和探針的用于多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測人肝癌細(xì)胞標(biāo)志物的試劑盒。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括dNTPs、Taq?DNA聚合酶、Mg2+、PCR反應(yīng)緩沖液、二甲基亞砜中的至少一種。
4.人早期肝癌細(xì)胞標(biāo)志物的多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測方法,其是利用權(quán)利要求1所述引物和探針,或權(quán)利要求2或3所述試劑盒對人早期肝癌細(xì)胞標(biāo)志物磷脂酰肌醇蛋白和甲胎蛋白的cDNA進(jìn)行多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)提取樣品組織中的總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA;
2)以步驟1)中的cDNA為模板,利用權(quán)利要求1所述引物和探針,進(jìn)行多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增反應(yīng);
3)利用甘油醛-3-磷酸脫氫酶的cDNA作為反應(yīng)內(nèi)參;
4)繪制擴(kuò)增曲線,進(jìn)行結(jié)果判定。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的檢測方法,其特征在于,步驟4)中進(jìn)行結(jié)果判定的標(biāo)準(zhǔn)為:以檢測后的特異性S擴(kuò)增曲線和閾值,即Ct值作為結(jié)果判定標(biāo)準(zhǔn),若無S曲線產(chǎn)生或Ct值≥40判定檢測結(jié)果為陰性,30<Ct值<40判定檢測的樣品組織為正常,Ct值<30判定檢測結(jié)果為陽性。
7.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的檢測方法,其特征在于,多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系為:1×Taq酶緩沖液、Taq?DNA聚合酶2-3U、dNTPS0.5mM、Mg2+1.25-1.5mM、2%二甲基亞砜、引物各0.25-0.5μmol、探針各0.2-0.4μmol和模板1-5μl。
8.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的檢測方法,其特征在于,多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性3min;95℃變性20sec,60℃退火30sec,72℃延伸30sec,共5個(gè)循環(huán);95℃變性20sec,50℃退火30sec,72℃延伸30sec,共40個(gè)循環(huán)。
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