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[發明專利]用于檢測EGFR基因熱點突變的引物、試劑盒和檢測方法無效

專利信息
申請號: 201310537369.1 申請日: 2013-11-04
公開(公告)號: CN103602734A 公開(公告)日: 2014-02-26
發明(設計)人: 梁超;熊凱;程宇;邢軍英;劉曉峰;侯然;朱立文;王緒華;方國偉;黃士昂;陳忠 申請(專利權)人: 北京海思特臨床檢驗所有限公司
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京天奇智新知識產權代理有限公司 11340 代理人: 陸軍
地址: 100176 北京市大興區亦*** 國省代碼: 北京;11
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摘要:
搜索關鍵詞: 用于 檢測 egfr 基因 熱點 突變 引物 試劑盒 方法
【說明書】:

技術領域

發明屬于分子生物學技術領域,涉及基因突變檢測引物和試劑盒,尤其涉及一種用于檢測EGFR基因熱點突變的引物、試劑盒和檢測方法。?

背景技術

表皮生長因子受體(epidermal?growth?factor?receptor,EGFR)是一種跨膜受體酪氨酸激酶,屬于受體酪氨酸激酶(tyrosine?kinase,TK)erbB/HER家族的一個成員,EGFR的激活即磷酸化對調節腫瘤細胞的生長、侵襲、轉化、存活、血管生成及轉移具有重要意義,研究表明,EGFR在許多惡性腫瘤中過高表達。?

近年來,隨著醫學分子生物學的發展,分子靶向治療作為惡性腫瘤治療的新手段,正日益受到臨床工作者們的重視,因此,EGFR作為惡性腫瘤治療的分子靶標而受到普遍關注。目前已開發出了吉非替尼(gefitinib)和厄洛替尼(erlotinib)等表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑(epidermal?growth?factor?receptor?tyrosine?kinases?inhibitor,EGFR-TKI),然而在臨床中,有些患者對EGFR-TKI的治療并不敏感或對該類藥物產生耐藥,故對EGFR-TKI耐藥機制的探索成為國內外研究的熱點。?

研究表明,這些靶向藥物的敏感性及耐藥性與腫瘤細胞EGFR突變密切相關。目前,在約半數耐藥患者中發現了EGFR第20外顯子T790M(T790M,threonine?at?position790)突變;而EGFR第19號外顯子內缺失突變和第21外顯子L858R突變則使突變細胞對藥物親和力增高,作用時間延長,對EGFR-TKI的敏感性增高。因此,在一線治療的惡性腫瘤患者中檢測EGFR基因突變具有重要的臨床意義,是決定患者是否能夠應用EGFR-TKI治療的先決條件。?

目前檢測EGFR突變主要通過直接測序法,該方法需要取得腫瘤組織標本,通過石蠟組織DNA提取,再進行PCR擴增、測序,最后對測序數據進行分析。這個方法對石蠟包埋組織標本要求高,要求標本中腫瘤組織含量達20%以上,檢測敏感度低,檢測流程復雜繁瑣,對數據分析要求高,且目前無商用試劑盒,對實驗室的儀器配備要求也較高。?

發明內容

為了解決上述技術問題,本發明的目的在于提供一種用于檢測EGFR基因熱點突變的引物,本發明還公開了包括有該引物的試劑盒及其使用方法。?

本申請的發明人根據EGFR基因的第19號外顯子內缺失突變(EXON19缺失突變)、第20外顯子T790M突變(EXON20T790M)和第21外顯子L858R突變(EXON21L858R)設計并合成了特異性引物,以外周血為樣本提取基因組DNA,可以快速檢測EGFR基因中這三處熱點突變,檢測敏感度高,可更高效地篩查出適宜EGFR-TKI治療方案的惡性腫瘤患者。?

根據本發明的實施例,提供了一種用于檢測EGFR基因熱點突變的引物,所述引物序列如下:?

SEQ?ID?NO:1?5’-ATCCCAGAAGGTGAGAAAGATAAAATTC-3’?

SEQ?ID?NO:2?5’-CCTGAGGTTCAGAGCCATGGA-3’?

SEQ?ID?NO:3?5’-AGAGCCATGGACCCCCACAC-3’?

SEQ?ID?NO:4?5’-CGAAGCCACACTGACGTGC-3’?

SEQ?ID?NO:5?5’-CGAAGGGCATGAGCCGC-3’?

SEQ?ID?NO:6?5’-CCTCCAGGAAGCCTACGTGA-3’?

SEQ?ID?NO:7?5’-CAGCCAGGAACGTACTGGTGA-3’?

SEQ?ID?NO:8?5’-TCCCTGGTGTCAGGAAAATGCT-3’?

SEQ?ID?NO:9?5’-CGCAGCATGTCAAGATCACAGAT-3’。?

根據本發明的實施例,還提供了一種用于檢測EGFR基因熱點突變的試劑盒,其主要包括:1)引物,所述引物序列如SEQ?ID?NO:1~SEQ?ID?NO:9所示,PCR?MIX反應液,針對不同突變進行酶切的限制性內切酶,BSA溶液,?酶切緩沖液,陰性對照品,陽性對照品,去離子水;2)分隔并集中包裝這些試劑的瓶或管以及包裝盒。?

優選的,上述引物的濃度均為5~10μmol/L。?

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