[發明專利]一種用于檢測BRAF基因熱點突變的試劑盒及其檢測方法有效
| 申請號: | 201310466109.X | 申請日: | 2013-10-09 |
| 公開(公告)號: | CN103571948A | 公開(公告)日: | 2014-02-12 |
| 發明(設計)人: | 陳剛;葉倫;李雪梅;付金玲 | 申請(專利權)人: | 武漢康錄生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 湖北武漢永嘉專利代理有限公司 42102 | 代理人: | 鄔麗明 |
| 地址: | 430075 湖北省武漢市*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 檢測 braf 基因 熱點 突變 試劑盒 及其 方法 | ||
1.一種用于檢測BRAF基因熱點突變的試劑盒,其特征在于,包括PCR反應液、PNA試劑、酶消化液、測序反應液、磁珠和產物純化液,所述PCR反應液包含PCR緩沖液、dNTPs、PCR正向引物、PCR反向引物、探針和DNA聚合酶,所述PCR正向引物的序列為SEQ.ID?NO.1,所述PCR反向引物的序列為SEQ.ID?NO.2,所述探針的序列為SEQ.ID?NO.3,所述探針的5’端的熒光基團為FAM,3’端的熒光基團為BHQ1;所述PNA的序列為SEQ.ID?NO.4;所述測序反應液包含Bigdye、Bigdye緩沖液和測序引物。
2.根據權利要求1所述試劑盒,其特征在于,所述PCR緩沖液由100mmol/LTris-HCl、500mmol/L?KCl和15mmol/L?MgCl2組成;所述dNTPs的摩爾濃度為2.5mmol/L?dNTPs;所述PCR正向引物的摩爾濃度為10μmol/L,所述PCR反向引物的摩爾濃度為10μmol/L;所述探針的摩爾濃度為10μmol/L;所述DNA聚合酶的酶活力單位濃度為5U/μl;所述PNA試劑的摩爾濃度為10μmol/L。
3.根據權利要求1所述試劑盒,其特征在于,所述酶消化液包括核酸外切酶Ⅰ和堿性磷酸酶。
4.根據權利要求3所述試劑盒,其特征在于,所述核酸外切酶Ⅰ和堿性磷酸酶的酶活力單位比為5:2。
5.根據權利要求1所述試劑盒,其特征在于,所述測序反應液含有5×Bigdye、2.5×Bigdye緩沖液和3μmol/L的測序引物。
6.根據權利要求1所述試劑盒,其特征在于所述產物純化液為0.75M氯化鈉溶液。
7.根據權利要求1所述試劑盒,其特征在于在所述PCR正向引物的5’端插入通用M13序列:TGTAAAACGACGGCCAGT,在所述PCR反向引物的5’端插入通用M13序列:CAGGAAACAGCTATGACC,則所述的測序引物序列為:TGTAAAACGACGGCCAGT。
8.一種使用權利要求1~7所述試劑盒檢測BRAF基因熱點突變的方法,其特征在于它包括如下步驟:
(1)目的基因熒光定量PCR擴增:使用試劑盒中的PCR反應液和PNA試劑,對樣品DNA進行PCR擴增反應,得到目的基因的熒光定量結果和PCR產物;
(2)根據步驟(1)中的定量結果,使用試劑盒中的酶消化液,對步驟(1)得到的PCR產物進行純化,得到純化后PCR產物;
(3)使用試劑盒中的測序反應液,對步驟(2)得到的純化后PCR產物進行測序PCR反應,得到測序PCR產物;
(4)使用試劑盒中的磁珠和產物純化液,對步驟(3)得到的測序PCR產物進行純化,得到純化后測序PCR產物;
(5)將步驟(4)得到的純化后測序PCR產物加樣至測序儀進行序列分析,測序所得基因序列與BRAF基因標準序列進行比對,判斷是否存在BRAF基因熱點突變。
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