[發明專利]檢測H1N1豬流感病毒的RT-PCR引物及試劑盒無效
| 申請號: | 201310462250.2 | 申請日: | 2013-09-30 |
| 公開(公告)號: | CN103571971A | 公開(公告)日: | 2014-02-12 |
| 發明(設計)人: | 馮淑萍;顏健華;熊毅;梁丹潔;李春英;孫翔翔 | 申請(專利權)人: | 廣西壯族自治區動物疫病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
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| 地址: | 530001 廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 h1n1 流感病毒 rt pcr 引物 試劑盒 | ||
技術領域
本發明屬于動物病毒分子生物檢測技術領域,具體涉及檢測H1N1豬流感病毒的RT-PCR引物及試劑盒。?
背景技術
H1Nl亞型豬流感病毒(Swine?influenza?virus,SIV)是豬流感(Swine?influenza,SI)的重要病原之一,為正粘病毒科、A型流感病毒屬,由8個分節段的基因組構成,共編碼10-11種蛋白。HINl亞型豬流感1918年美國最先報道,Shope于1930年第一次分離鑒定該亞型病毒,這也是首次確診豬流感病毒,此后不斷傳播,現已在五大洲都發現其蹤跡。該病毒可感染豬,引起豬發生急性、熱性呼吸器官傳染病,主要以突發的呼吸系統并轉歸迅速的綜合癥狀為特征,是豬呼吸道綜合征癥候群疾病之一。由于豬流感病毒對呼吸道上皮細胞具有親嗜特性,可對其造成損傷,在臨床上豬群的發病率可高達100%,病死率1%~4%,如伴隨其他呼吸系統疾病的繼發、混合感染,會導致豬群的損傷程度和病死率會大幅度增高。目前,從豬體中分離到流感病毒有H1N1、H1N2、H3N2、H1N7、H4N6、H3N6、H5N1和H9N2等多個亞型的病毒,能引起豬流感癥狀并在當今豬群中傳播主要有3個亞型,H1N1、H3N2和H1N2,而H1N1在豬流感病毒中占優勢地位,近些年世界各地分離到的豬流感病毒亞型大部分都是H1Nl。Sreta等研究發現H1N1致病力較其它豬流感病毒更強,感染斷奶乳豬仔豬的肺損傷度比H3N2的嚴重,極大危害豬群的健康。值得注意的是,已有報道美國于2005年12月至2009年2月出現的10例H1N1亞型和1例是H1N2豬流感病毒感染人病例,其中證實9例與豬有直接接觸史,2009年3月始發于墨西哥的21世紀甲型H1N1流感大流行,令此亞型流感病毒愈加受到高度的重視。?
H1N1豬流感根據病毒基因片段來源不同,可分為古典型H1N1豬流感、類禽型H1Nl豬流感和類人型H1Nl豬流感。三類H1N1豬流感病毒在世界各地處于不同階段的流行情況各不相同。因此建立有效的診斷方法對防治H1Nl亞型豬流感具有重要意義。?
發明內容
本發明的目的是提供檢測H1N1豬流感病毒的RT-PCR引物及試劑盒,具有較高的靈敏度和特異性,且檢測成本低,有良好的應用前景。?
本發明的技術方案為:?
檢測H1N1豬流感病毒的RT-PCR引物,所述引物為兩對:針對H1基因的引物和針對N1?基因的引物,所述針對H1基因引物的上游引物ɑHu核苷酸序列為5’-GGAATGGTAGATGGATGGT-3’,下游引物Hd核苷酸序列為5’-ACCCATTAGAACACATCCAGAA-3’,針對N1基因引物的上游引物Nu核苷酸序列為5’-TCCAAGGGGGATGTGTTTG-3’,下游引物Nd核苷酸序列為5’-GACCAAGCGACTGACTCAA-3’。?
一種檢測H1N1豬流感病毒的試劑盒,所述試劑盒包括以上所述的引物。?
以上所述檢測H1N1豬流感病毒的試劑盒,所述試劑盒還包括:RNA提取試劑、RT反應試劑、PCR反應試劑、陰性對照和陽性對照。?
所述RNA提取試劑包括:Trizol裂解液、氯仿、異丙醇和75%的DEPC乙醇;?
所述RT反應試劑包括:5×buffer緩沖液、dNTPs、HIR、Uni12;?
所述PCR反應試劑包括:Taq?DNA酶、10×buffer緩沖液、dNTPs、MgCl2和cDNA;?
所述陰性對照包括:DEPC水;?
所述陽性對照包括:古典型H1N1豬流感病毒、類禽型H1Nl豬流感病毒和類人型H1Nl豬流感病毒。?
所述古典型H1N1豬流感病毒可為古典型H1N1豬流感毒株,如:廣西壯族自治區動物疫病預防控制中心實驗室分離保存的古典型H1N1豬流感毒株;所述類禽型H1Nl豬流感病毒可為類禽型H1Nl豬流感毒株,如:廣西壯族自治區動物疫病預防控制中心實驗室分離保存的類禽型H1Nl豬流感毒株;所述類人型H1Nl豬流感病毒可為類人型H1Nl豬流感毒株,如:廣西壯族自治區動物疫病預防控制中心實驗室分離保存的類人型H1Nl豬流感毒株。?
本發明的具體原理是利用H1N1豬流感病毒的同源性,應用OLIG6.0軟件,合成針對H1基因和N1基因的兩對靶核苷酸序列的特異性引物,用RT-PCR方法擴增出特異性的目的帶。試驗方法及過程如下:?
1.引物設計:?
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