[發(fā)明專利]包括3895C>T突變的CYP2D6基因片段、所編碼的蛋白質(zhì)片段及其應用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201310407836.9
• 申請日: 2013-09-09
• 公開（公告）號: CN103627715A
• 公開（公告）日: 2014-03-12
• 發(fā)明（設計）人: 蔡劍平;胡國新;戴大鵬;耿培武;蔡杰
• 申請（專利權(quán)）人: 蔡劍平
• 主分類號: C12N15/53
• 分類號: C12N15/53;C12N15/11;C12Q1/68;C12N9/02
• 代理公司: 北京邦信陽專利商標代理有限公司 11012
• 代理人: 陳悅軍

技術領域

本發(fā)明屬于生物學領域，涉及CYP2D6等位基因第3895位的單堿基突變。更具體地，本發(fā)明涉及包含該突變位點的核酸片段及其相應編碼的蛋白質(zhì)片段、鑒定所述突變位點的試劑、檢測方法和鑒定該位點在指導用藥中的應用。?

背景技術

細胞色素P4502D6（CYP2D6）是CYP酶家族重要的成員之一。其基因位于第22號染色體上，包括9個外顯子，基因全長9432bp（GenBank注冊號M33388，外顯子區(qū)位于第1620-5909位）。人體內(nèi)該細胞色素的量只占肝臟酶總量的2%～4%，卻參與臨床上20%～30%藥物的代謝，這樣藥物包括抗抑郁藥、抗心律失常藥、抗精神病藥、鎮(zhèn)痛藥、止咳藥、止吐藥、抗糖尿病藥及β受體阻滯藥等，研究其代謝多態(tài)性具有十分重要的臨床應用價值（參見參考文獻1）。?

CYP2D6基因具有高度多態(tài)性。目前為止，NCBI?SNP數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)收錄了超過300個突變位點。由CYP450國際命名委員命名的等位基因也已有150多個，另外還有多種新發(fā)現(xiàn)的突變型尚未被命名（http://www.cypalleles.ki.se/cyp2d6.htm）。每個等位基因都不同程度涉及點突變、缺失、插入、重排等，從而影響CYP2D6的活性，進而影響對藥物的代謝活性，產(chǎn)生不同程度的藥物效應。除去野生型CYP2D6*1外，目前研究較多且臨床意義較大的突變型主要包括以下7種：CYP2D6*2、*3、*4、*5、*10、*17、*41，其中人種分布最廣、研究最多、中國人群研究資料相對最豐富的突變型是CYP2D6*2（2850C>T；4180G>C）和CYP2D6*10（100C>T；4180G>C）（參見參考文獻1、2、3）。?

根據(jù)目前的臨床研究顯示，CYP2D6基因的這種多態(tài)性是造成CYP2D6酶活性在個體之間差異顯著的主要原因，攜帶不同CYP2D6基因型的個體間可引起藥物療效的極大差異，甚至產(chǎn)生嚴重的藥物毒副作用或治療不充分。因此，研究CYP2D6基因多態(tài)性對藥物療效的影響將對臨床合理用藥提供重要的科學依據(jù)（參見參考文獻3、4）。?

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供CYP2D6基因的新的單堿基突變位點，包含該突變位點的核酸片段、其編碼的蛋白質(zhì)片段及鑒定該突變位點在用藥指導中的應用。?

本發(fā)明的第一個方面是提供核酸片段，所述核酸片段包含對應于SEQ?ID?NO.1的第3895位的突變位點，且是SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列中的至少10個連續(xù)核苷酸，其中第3895位的核苷酸是T；或者所述核酸片段包含對應于SEQ?ID?NO.2的第1270位的突變位點，且是SEQ?ID?NO.2所示的核苷酸序列中的至少10個連續(xù)核苷酸，其中第1270位的核苷酸是T；或者所述核酸片段為上述核酸片段的反向互補序列。?

本發(fā)明的第二個方面是提供與含有對應于SEQ?ID?NO.1的第3895位或?qū)赟EQ?ID?NO.2的第1270位的突變位點的等位基因片段或其反向互補序列全部或部分雜交的等位基因特異性寡核苷酸，其中SEQ?ID?NO.1的第3895位或SEQ?ID?NO.2的第1270位的突變位點的核苷酸是T；所述等位基因片段是SEQ?ID?NO.1或SEQ?ID?NO.2所示的核苷酸序列中的至少10個連續(xù)核苷酸或其反向互補序列。?

本發(fā)明的第三個方面是提供用于檢測和/或分析本發(fā)明的單堿基突變的試劑盒，所述試劑盒包含本發(fā)明的核酸片段或等位基因特異性寡核苷酸，或包含能夠作為引物擴增所述單堿基突變但不包含該單堿基的核酸片段；所述單堿基對應于SEQ?ID?NO.1的第3895位或SEQ?ID?NO.2的第1270位。?

本發(fā)明的第四個方面是提供本發(fā)明的核酸片段或寡核苷酸在檢測CYP2D6基因突變中的應用，其中所述核酸片段或寡核苷酸用作探針或引物；或者本發(fā)明的核酸片段或寡核苷酸用于制備檢測CYP2D6基因突變的藥物的應用；或者本發(fā)明的核酸片段或寡核苷酸用作檢測CYP2D6基因突變的檢驗標志物的應用。?

本發(fā)明的第五個方面是提供一種用藥指導，包括檢測待測樣品中CYP2D6基因的對應于SEQ?ID?NO.1的第3895位或SEQ?ID?NO.2的第1270位的單堿基突變；根據(jù)檢測到的突變，調(diào)整由CYP2D6代謝的藥物的給藥量。?