[發明專利]檢測齲齒蛋白的質譜模型及構建方法有效
申請號: | 201310368422.X | 申請日: | 2013-08-22 |
公開(公告)號: | CN103483442A | 公開(公告)日: | 2014-01-01 |
發明(設計)人: | 張學記;馬慶偉;李燕;劉曉霏;林燕 | 申請(專利權)人: | 向華 |
主分類號: | C07K14/47 | 分類號: | C07K14/47;G01N30/72 |
代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
地址: | 410128 湖南省長沙市*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索關鍵詞: | 檢測 齲齒 蛋白 模型 構建 方法 | ||
1.用于檢測齲齒特征蛋白的唾液特征蛋白組合,由表征質荷比為3324.8m/z、3186.2m/z、3195.8m/z的齲齒特征蛋白組成,其中氨基酸序列分別為SEQ?ID?No.1、SEQ?IDNo.2、SEQ?ID?No.3,如下所示:?
SEQ?ID?No.1:Lys-Met-Thr-Glu-Ala-Gln-Glu-Asp-Gly-Gln-Ser-Thr-Ser-Glu-Leu-Ile-Gly-Gln-Phe-Gly-Val-Gly-Phe-Tyr-Ser-Ala-Phe-Leu-Val-Ala-Asp-Lys-Val;?
SEQ?ID?No.2:Lys-Ser-Ser-Ser-Tyr-Ser-Lys-Gln-Phe-Thr-Ser-Ser-Thr-Ser-Tyr-Asn-Arg-Gly-Asp-Ser-Thr-Phe-Glu-Ser-Lys-Ser-Tyr-Lys-Met-Ala;?
SEQ?ID?No.3:Gln-Asp-Glu-Pro-Pro-Gln-Ser-Pro-Trp-Asp-Arg-Val-Lys-Asp-Leu-Ala-Thr-Val-Tyr-Val-Asp-Val-Leu-Lys-Asp-Ser-Gly-Arg-Asp-Tyr。
2.權利要求1所述的特征蛋白組合,其中當3324.8m/z、3186.2m/z、3195.8m/z的峰都下調表達時表示該特征蛋白在齲齒易感人群中均低表達。?
3.用于檢測齲齒特征蛋白的質譜模型,包括權利要求1和2所述的唾液特征蛋白。?
4.一種用于檢測齲齒易感人群的試劑盒,其包含權利要求1和2所述的唾液特征蛋白組合,或包含權利要求3所述的質譜模型。?
5.權利要求1和2所述唾液特征蛋白組合,或權利要求3所述的質譜模型,質譜模型在制備診斷齲齒易感人群試劑中的用途。?
6.制備權利要求3所述質譜模型的方法,包括如下步驟:?
1)收集多例臨床確診的齲齒患者唾液和正常對照人員的唾液作為兩組唾液標本,進行低溫冷凍備用;?
2)對唾液蛋白進行質譜前預處理;?
3)對預處理過的兩組唾液蛋白進行質譜檢測讀取,獲得兩組唾液多肽的指紋圖譜;?
4)對所有的齲齒患者和正常人唾液多肽的指紋圖譜進行標準化處理,并收集數據;?
5)對所得數據進行質控處理,篩選出具有下列質荷比峰的三個齲齒特征蛋白:3324.8m/z、3186.2m/z和3195.8m/z,對所述特征蛋白進行多肽序列測定,并根據這三個質荷比峰建立檢測齲齒易感性篩查的質譜模型。?
7.如權利要求5所述的方法,其特征在于,其中步驟2)預處理的方法包括使用磁珠純化和穩定樣品中的血清蛋白或多肽。?
8.如權利要求5所述的方法,其中所述步驟3)采用WCX2芯片對兩組血清蛋白進行吸附,并對結合在弱陽離子WCX2芯片上的兩組血清蛋白進行讀取,獲得兩組血清多肽的指紋圖譜。?
9.如權利要求5所述的方法,其中所述步驟5)所述的質控處理,保留出峰數量大于50的質譜?圖譜數據,并采用Sigma血清的組內變異系數來保證實驗的一致性,從而根據變異系數滿足一致性的允許范圍來進行篩選,所述變異系數為14.9%。?
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