[發明專利]基于LAMP的桃內標準基因快速檢測試劑盒及其檢測方法有效
| 申請號: | 201310312627.6 | 申請日: | 2013-07-24 |
| 公開(公告)號: | CN104178558A | 公開(公告)日: | 2014-12-03 |
| 發明(設計)人: | 許文濤;黃昆侖;閆興華;翟百強;羅云波;徐瑗聰;商穎;董凱 | 申請(專利權)人: | 北京福德安科技有限公司;中國農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 無 | 代理人: | 無 |
| 地址: | 100083 北京市海淀區*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 lamp 標準 基因 快速 檢測 試劑盒 及其 方法 | ||
1.一種桃內標準基因的環介導等溫擴增檢測引物組,其特征在于,由下列引物組成:?
上游外引物,peach-F3:ATTGCACCAATTTGCCAG?
下游外引物,peach-B3:TGACTATGCTCTCCTGTTC?
上游內引物,peach-FIP:CACATCAGCAACATTCTATTGGTTC-?
???????????????????????ACCTCTCTCTCACTAGAACA?
下游內引物,peach-BIP:ATCCACAACATCTTCACATTCCC-?
???????????????????????GGCCTAATGAGATGCCTTG。?
2.一種桃內標的檢測方法,其特征在于,以桃葉綠體a/b結合蛋白(Lhcb2)(EF127291.1)基因為靶基因,通過環介導等溫擴增方法用權利要求1所述的檢測引物對樣品的DNA選擇性擴增所述的靶基因片段,確認是否存在有擴增產物。?
3.根據權利要求2所述的桃內標的檢測方法,其特征在于,該檢測方法具體為:?
(1)模板的提取:將樣品在液氮中磨成粉末,稱20mg±1mg樣品,用CTAB方法提取基因組。?
(2)環介導等溫擴增體系包括:1.4-2.0mM?dNTP、2-8mM?MgSO4、0.6-1.0M甜菜堿,0.2-1.6μM外引物(peach-F3,peach-B3)、0.2μM內引物(peach-FIP,peach-BIP)、3.2-8.0U?Bst?DNA聚合酶、1x?Thermopol?buffer(包含:20mM?Tris-HCl(pH8.8@25℃),10mM?KCl,10mM(NH4)2SO4,2mM?MgSO4,0.1%.Triton?X-100),用ddH2O補充體系至25μL。定量體系中將1μL?ddH2O換成1μL的20X?SYBR?Green?I。?
(3)環介導等溫反應產物的檢測:?
利用電泳檢測、熒光檢測環介導反應產物是否有擴增產物。?
4.根據權利要求3所述的檢測方法,其特征在于,所述的樣品為桃葉。?
5.根據權利要求3所述的檢測方法,其特征在于,(2)中定量檢測樣品的最低限度為10pg,并且有標準曲線方程。?
6.根據權利要求3所述的桃內標環介導等溫擴增技術快速診斷試劑盒,其特征在于,普通定性環介導等溫擴增反應程序:60-65℃反應40min。反應所使用的儀器為普通PCR、水浴鍋以及恒溫培養箱。?
7.根據權利要求3所述的桃內標環介導等溫擴增技術快速診斷試劑盒,其特征在于,定量環介導等溫擴增反應程序:64℃反應3min,50個循環:64℃30s,64℃30s。反應所使用的儀器為定量PCR。?
8.桃內標環介導等溫擴增技術快速檢測試劑盒,其特征在于,該試劑盒包括如權利要求1所述的引物組、權利要求3所述的反應液、Bst?DNA聚合酶、顯色劑以及一張陽性定量標準曲線。?
9.根據權利要求6所述的桃內標環介導等溫擴增技術快速檢測試劑盒,其特征在于,所述的引物組由體積比為1:1:8:8的上下游外引物和上下游內引物組成。?
10.根據權利要求6所述的桃內標環介導等溫擴增技術快速檢測試劑盒,其特征在于,反應液是由體積比為5:8:1:8的1x?Thermopol?buffer、1.4-2.2mM?dNTP、3-9mM?MgSO4、0.4-1.0M甜菜堿組成。?
11.根據權利要求6所述的桃內標環介導等溫擴增技術快速診斷試劑盒,其特征在于,Bst?DNA聚合酶每微升含3-8個活性單位。?
12.根據權利要求6所述的桃內標環介導等溫擴增技術快速診斷試劑盒,其特征在于,試劑盒還包括SYBR?GREEN?Ⅰ熒光染料,稀釋后可作為顯色劑,另外還有一份定量標準曲線圖。?
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