[發明專利]AAGAB基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201310264083.0
• 申請日: 2013-06-27
• 公開（公告）號: CN104178489B
• 公開（公告）日: 2017-09-19
• 發明（設計）人: 張學軍;王俊;楊森;肖若;孫良丹;張青;高敏;崔紅宙;王文俊
• 申請（專利權）人: 安徽醫科大學第一附屬醫院;深圳華大基因股份有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/68;C12M1/34;C12N15/63;C12N1/21;C12N5/10
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙)11201
• 代理人: 李志東

優先權信息

本申請請求2013年5月23日向中國國家知識產權局提交的、專利申請號為201310234269.1的專利申請的優先權和權益，并且通過參照將其全文并入此處。

技術領域

本發明涉及AAGAB基因突變體及其應用。具體地，本發明涉及分離編碼AAGAB突變體的核酸，分離的多肽，篩選易患I型點狀掌跖角化癥的生物樣品的方法，篩選遺憾I型點狀掌跖角化癥的生物樣品的系統，用于篩選易患I型點狀掌跖角化癥的生物樣品的試劑盒，構建體以及重組細胞。

背景技術

點狀掌跖角化病（PPPK；OMIM：148600）是一種以不規則分布于掌跖的大量的角化性斑塊為特征的罕見的常染色體顯性遺傳性疾病，其典型臨床表現為雙手掌與足跖部位的圓形或卵圓形、較硬的黃色或淡黃色角質丘疹，若去除角質丘疹后，局部可留有火山口樣的凹坑，可以伴有甲變形，典型的點狀皮損可以融合成塊，可能與遭受連續性高壓有關，一般足跖部位皮疹比掌部較大，少數患者也可不僅累及掌跖部位，其他部位如膝部、手足背部、肘部也可受累。其中，I型點狀掌跖角化癥（Punctate palmoplantar keratoderma type I，PPKP1），又稱為點狀掌跖角化病Buschke-Fischer-Brauer型，其發病機制復雜、并且具有高度遺傳異質性。

現階段，尋找致病基因對疾病診斷或治療意義重大。雖然目前已發現多個PPKP1的致病基因，涉及較多致病突變，但仍存在著相當一部分未知的致病基因及致病位點。

因而，目前對I型點狀掌跖角化癥的研究仍有待深入。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出一種能夠有效篩選易患I型點狀掌跖角化癥的生物樣品的方法。

本發明是基于發明人的下列工作完成的：發明人通過目標區域捕獲測序聯合候選基因突變驗證的方法確定了I型點狀掌跖角化癥的新的致病基因——AAGAB基因，并發現了六個AAGAB基因上的治病突變：c.552_554TAG>AT、C.535+1G>A、c.755_756insAAGCCAGTCT、c.725T>G、c.352_355delTCTG和c.481C>T。

根據本發明的第一方面，本發明提出了一種分離的編碼AAGAB突變體的核酸。根據本發明的實施例，所述核酸與SEQ ID NO：1相比，具有選自下列的至少一種突變：c.552_554TAG>AT、C.535+1G>A、c.755_756insAAGCCAGTCT、c.725T>G、c.352_355delTCTG和c.481C>T。根據本發明的實施例，發明人確定了AAGAB基因的新突變體，該突變體與I型點狀掌跖角化癥的發病密切相關，從而通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患I型點狀掌跖角化癥。

根據本發明的第二方面，本發明提出了一種分離的多肽。根據本發明的實施例，與SEQ ID NO：2相比，所述分離的多肽具有選自下列的至少一種突變：p.Phe184Leufs*6、p.Leu252Leufs*14、p.Leu242*、p.Ser118Lysfs*3和p.Arg161*。通過檢測生物樣品中是否表達該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易患I型點狀掌跖角化癥。

根據本發明的第三方面，本發明提出了一種篩選易患I型點狀掌跖角化癥的生物樣品的方法。根據本發明的實施例，該方法包括以下步驟：從所述生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO：1相比，具有選自下列的至少一種突變：c.552_554TAG>AT、C.535+1G>A、c.755_756insAAGCCAGTCT、c.725T>G、c.352_355delTCTG和c.481C>T是所述生物樣品易患I型點狀掌跖角化癥的指示。通過根據本發明實施例的篩選易患I型點狀掌跖角化癥的生物樣品的方法，可以有效地篩選易患I型點狀掌跖角化癥的生物樣品。