[發明專利]AQP5基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201310242094.9
• 申請日: 2013-06-17
• 公開（公告）號: CN103275987A
• 公開（公告）日: 2013-09-04
• 發明（設計）人: 戴蘭蘭;張建國;蔣慧;楊勇;林志淼;曹旭;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/68;C12M1/00;C12N5/10
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 李志東

技術領域

本發明涉及AQP5基因突變體及其應用。具體地，本發明涉及分離編碼AQP5突變體的核酸，分離的多肽，篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的方法，篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的系統，用于篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的試劑盒，構建體以及重組細胞。

背景技術

掌跖角化癥（Palmoplantar?keratoderma，PPK）是一種遺傳異質性較強的疾病，臨床特點表現為是手掌和腳底表皮增厚。根據臨床表型，可將掌跖角化癥分成4個亞型：彌漫型、點狀、片狀、條紋型。彌漫性掌跖角化癥可被進一步細分成表皮松懈和非表皮松懈型掌跖角化癥。其中一種非表皮松懈掌跖角化癥被稱為Bothnia型掌跖角化癥（PPK?type?Bothnia，PPKB），這種病最初在兩個瑞典家庭中被發現，并被導報在瑞典Bothnia一帶流行發病，在兩個瑞典城市的流行率高達0.3%到0.55%。PPKB的臨床特點包括：彌漫性，表型一致，掌跖角化過度伴角質層腫脹，其中PPKB一個獨特的臨床表征為：接觸水后角質層呈現白色海綿狀外觀。

PPKB是一種常染色體顯性遺傳模式疾病，前期通過遺傳連鎖分析和定位克隆研究，科學家已成功定位到一個14-cM的區域，12q11-12q13。但是，截至目前，PPKB的致病基因仍無報道。

因而，目前對Bothnia型掌跖角化癥的研究尤其是致病基因的確定仍有待深入。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出一種能夠有效篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的方法。

本發明是基于發明人的下列工作完成的：發明人通過外顯子組測序聯合候選基因突變驗證的方法確定了Bothnia型掌跖角化癥的一個致病基因及其突變——AQP5基因的c.367A>T突變。

根據本發明的第一方面，本發明提出了一種分離的編碼AQP5突變體的核酸。根據本發明的實施例，所述核酸與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.367A>T突變，即相對于野生型AQP5基因，本發明的AQP5基因突變體的第367位堿基從A突變為T。根據本發明的實施例，發明人確定了AQP5基因的突變體，該突變體與Bothnia型掌跖角化癥的發病密切相關，從而通過檢測該突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患Bothnia型掌跖角化癥。

根據本發明的第二方面，本發明提出了一種分離的多肽。根據本發明的實施例，與SEQID?NO：2相比，所述分離的多肽具有p.N123Y突變，即該突變是由于c.367A>T的雜合錯義突變而引起的，具體地，相對于野生型AQP5，本發明的分離的多肽（即AQP5突變體）的第123位N突變為Y。通過檢測生物樣品中是否表達該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易患Bothnia型掌跖角化癥。

根據本發明的第三方面，本發明提出了一種篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的方法。根據本發明的實施例，該方法包括以下步驟：從所述生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.367A>T突變是所述生物樣品易患Bothnia型掌跖角化癥的指示。通過根據本發明實施例的篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的方法，可以有效地篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品。

根據本發明的第四方面，本發明提出了一種篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的系統。根據本發明的實施例，該系統包括：核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，是否具有c.367A>T突變，判斷所述生物樣品是否易患Bothnia型掌跖角化癥。利用該系統，能夠有效地實施前述篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品。