[發明專利]AQP5基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201310242094.9
• 申請日: 2013-06-17
• 公開（公告）號: CN103275987A
• 公開（公告）日: 2013-09-04
• 發明（設計）人: 戴蘭蘭;張建國;蔣慧;楊勇;林志淼;曹旭;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/68;C12M1/00;C12N5/10
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 李志東

1.一種分離的編碼AQP5突變體的核酸，其特征在于，所述核酸與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.367A>T突變，

任選地，所述核酸為DNA。

2.一種分離的多肽，其特征在于，與SEQ?ID?NO：2相比，所述分離的多肽具有p.N123Y突變，

任選地，所述多肽是由權利要求1所述的核酸編碼的。

3.一種篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的方法，其特征在于，包括以下步驟：

從所述生物樣品提取核酸樣本；

確定所述核酸樣本的核酸序列；

所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.367A>T突變是所述生物樣品易患Bothnia型掌跖角化癥的指示，

任選地，所述生物樣本為選自人體血液、皮膚、皮下組織的至少一種，

任選地，所述核酸樣本為全基因組DNA。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，從所述生物樣品提取核酸樣本進一步包括：

從所述生物樣品提取RNA樣本，優選所述RNA樣本為mRNA；以及

基于所述RNA樣本，通過反轉錄反應，獲得cDNA樣本，所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

5.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，確定所述核酸樣本的核酸序列進一步包括：

針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫；以及

對所述核酸測序文庫進行測序，以便獲得由多個測序數據構成的測序結果，任選地，采用選自Hiseq2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種對所述核酸測序文庫進行測序，

任選地，針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫進一步包括：

利用AQP5基因外顯子特異性引物，對所述核酸樣本進行PCR擴增；以及

針對所得到的擴增產物，構建所述核酸測序文庫，

任選地，所述特異性引物具有如SEQ?ID?NO：5-6所示的核苷酸序列。

6.一種篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的系統，其特征在于，包括：

核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；

核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；

判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，是否具有c.367A>T突變，判斷所述生物樣品是否易患Bothnia型掌跖角化癥，

任選地，所述核酸提取裝置進一步包括：

RNA提取單元，所述RNA提取單元用于從所述生物樣品提取RNA樣本；以及

反轉錄單元，所述反轉錄單元與所述RNA提取單元相連，用于對所述RNA樣本進行反轉錄反應，以便獲得cDNA樣本，所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

7.根據權利要求6所述的系統，其特征在于，所述核酸序列確定裝置進一步包括：

文庫構建單元，所述文庫構建單元用于針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫；以及

測序單元，所述測序單元與所述文庫構建單元相連，用于對所述核酸測序文庫進行測序，以便獲得由多個測序數據構成的測序結果，

任選地，所述文庫構建單元進一步包括：

PCR擴增模塊，所述PCR擴增模塊中設置有AQP5基因外顯子特異性引物，以便利用所述特異性引物，對所述核酸樣本進行PCR擴增，

任選地，所述特異性引物具有如SEQ?ID?NO：5-6所示的核苷酸序列，

任選地，所述測序單元包括選自HISEQ2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種。

8.一種用于篩選易患Bothnia型掌跖角化癥的生物樣品的試劑盒，其特征在于，含有：

適于檢測AQP5基因突變體的試劑，其中與SEQ?ID?NO：1相比，所述AQP5基因突變體具有c.367A>T突變，

任選地，所述試劑為核酸探針或引物，

任選地，所述核酸探針或引物具有如SEQ?ID?NO：5-6所示的核苷酸序列。

9.一種構建體，其特征在于，包含權利要求1所述的分離的編碼AQP5突變體的核酸。

10.一種重組細胞，其特征在于，所述重組細胞是通過權利要求9所述的構建體轉化受體細胞而獲得的。