[發明專利]一種高通量全基因組DNA甲基化檢測技術無效
| 申請號: | 201310163085.0 | 申請日: | 2013-05-06 |
| 公開(公告)號: | CN103233072A | 公開(公告)日: | 2013-08-07 |
| 發明(設計)人: | 王師;呂佳;包振民;張玲玲;胡曉麗;陸維 | 申請(專利權)人: | 中國海洋大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 青島海昊知識產權事務所有限公司 37201 | 代理人: | 曾慶國 |
| 地址: | 266003 *** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 通量 基因組 dna 甲基化 檢測 技術 | ||
1.一種全基因組DNA甲基化檢測方法,包括如下的步驟:
1)將基因組DNA用內切酶FspEI酶進行酶切,獲得酶切片段;
2)將酶切片段的兩端分別連接上接頭,作為擴增引物的結合點;
3)將連接上接頭的酶切片段用引物進行第一輪PCR擴增,從而富集接頭連接正確的酶切片段;
4)將第一輪PCR擴增產物經凝膠純化后用引物進行第二輪PCR擴增,引入Barcode來構建測序文庫;
5)測序文庫進行測序;將測序數據進行分析得到全基因組甲基化信息。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于所述的步驟2)中的接頭,為接頭slx1和slx2,其中構成slx1的兩個核苷酸片段,其序列分別為SEQ?ID?NO:1和SEQ?ID?NO:2;
構成slx2的兩個核苷酸片段,其序列分別為SEQ?ID?NO:3和SEQ?ID?NO:2。
3.如權利要求1所述的方法,其特征在于所述的步驟3)中的引物的核苷酸序列分別為SEQ?ID?NO:4和SEQ?ID?NO:5。
4.如權利要求1所述的方法,其特征在于所述的步驟4)中的引物的核苷酸序列分別為SEQ?ID?NO:4和SEQ?ID?NO:6。
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