[發明專利]冠心病相關基因SNP檢測芯片及使用方法有效
| 申請號: | 201310116606.7 | 申請日: | 2013-04-03 |
| 公開(公告)號: | CN104099403A | 公開(公告)日: | 2014-10-15 |
| 發明(設計)人: | 韓雅玲;張效林;閆承慧;張佳琦;康健;黃明方;鄔澤峰;席素雅 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍沈陽軍區總醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C40B40/06 |
| 代理公司: | 上海伯瑞杰知識產權代理有限公司 31227 | 代理人: | 吳瑾瑜 |
| 地址: | 110840 遼*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 冠心病 相關 基因 snp 檢測 芯片 使用方法 | ||
1.一種冠心病相關基因SNP檢測芯片,包括固相支持物和固定在所述固相支持物上的寡核苷酸探針,其特征在于,所述寡核苷酸探針為包含以下序列中的IL-8-251A/T、IL-17A?rs8193037G/A、IL-18-607C/A、MMP-1-519A/G和Connexin37C1019T位點在內的含17-32個連續核苷酸的10個核苷酸序列。?
2.權利要求1所述冠心病相關基因SNP檢測芯片,其特征在于,所述寡核苷酸探針序列如SEQ?ID?No.1~10所示,其中SEQ?ID?No.1和SEQ?ID?No.2包含IL-8-251A/T,SEQ?ID?No.3和SEQ?ID?No.4包含IL-17A?rs8193037G/A,SEQ?ID?No.5和SEQ?ID?No.6包含IL-18-607C/A,SEQ?ID?No.7和SEQ?ID?No.8包含MMP-1-519A/G,SEQ?ID?No.9和SEQ?ID?No.10包含Connexin37C1019T;?
SEQ?ID?No.1:AAAGCATACATTTGATAATTCACC?
SEQ?ID?No.2:AAAGCATACAATTGATAATTCACC?
SEQ?ID?No.3:CTGCGACACGCCACGTAA?
SEQ?ID?No.4:ACTGCGACACACCACGTAAG?
SEQ?ID?No.5:ATCATTAGAATTTTATGTAATAATTTTTACAC?
SEQ?ID?No.6:ATCATTAGAATTTTATTTAATAATTTTTACAC?
SEQ?ID?No.7:CAATAGGGTACCAGGCAGC?
SEQ?ID?No.8:CAATAGGGTGCCAGGCAG?
SEQ?ID?No.9:GCCAAAAACCCCCAAGT?
SEQ?ID?No.10:GCCAAAAATCCCCAAGTC。?
3.權利要求1或2所述冠心病相關基因SNP檢測芯片,其特征在于,所述IL-8-251A/T,IL-17A?rs8193037G/A,IL-18-607C/A,MMP-1-519A/G,Connexin37C1019T位于所述寡核苷酸探針的中部。?
4.權利要求1或2所述冠心病相關基因SNP檢測芯片,其特征在于,所述寡核苷酸探針的5’端還包含一段氨基修飾的16-25聚的聚脫氧胸苷酸。?
5.權利要求4所述冠心病相關基因SNP檢測芯片,其特征在于,所述探針的5’端還包含氨基修飾的16聚的聚脫氧胸苷酸。?
6.權利要求1~5任一項所述冠心病相關基因SNP檢測芯片的使用方法,其?特征在于,包括以下步驟:?
(1)制備待測樣品的基因組DNA;?
(2)用聚合酶鏈反應方法擴增IL-8基因中包含-251A/T、IL-17A基因中包含rs8193037G/A、IL-18基因中包含-607C/A、MMP-1基因中包含-519A/G和Connexin37基因中包含C1019T的基因片段;?
(3)將所得擴增產物與雜交緩沖液混合;?
(4)將上述混合液與權利要求1~5任一項所述冠心病相關基因SNP檢測芯片雜交;?
(5)檢測芯片的雜交信號。?
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