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[發明專利]一種利用Flag蛋白標簽沉淀目的蛋白的染色質免疫共沉淀技術無效

專利信息
申請號: 201310073374.1 申請日: 2013-03-08
公開(公告)號: CN103146685A 公開(公告)日: 2013-06-12
發明(設計)人: 張玉祥;賴瑞 申請(專利權)人: 首都醫科大學
主分類號: C12N15/10 分類號: C12N15/10;C12N15/79
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 100069 北*** 國省代碼: 北京;11
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 利用 flag 蛋白 標簽 沉淀 目的 染色質 免疫 共沉淀 技術
【權利要求書】:

1.此項方法是一種利用Flag蛋白標簽沉淀目的蛋白與靶基因的染色質免疫共沉淀(Chromatin?Immunoprecipitation,ChIP)技術,其主要目的是研究轉錄因子,此方法的獨特之處在于:構建一個目的蛋白基因序列連接有Flag蛋白標簽序列的表達載體,將至轉染進特定細胞內,利用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的蛋白與靶基因的DNA-蛋白復合物的染色質免疫共沉淀技術(ChIP)。

2.根據權利要求1所述的技術方法,其特征在于用Flag蛋白標簽抗體替代目的蛋白抗體進行染色質免疫共沉淀(ChIP),它的特點是:a.提高了傳統ChIP的特異性;b.減少了抗體的使用。

3.根據權利要求2所述的技術方法,其特征在于包括以下步驟:

(1)構建目的蛋白基因序列連接有3×Flag蛋白標簽序列的真核表達載體(質粒);

(2)將構建好的表達載體(質粒)轉染進特定的細胞系中進行表達;

(3)用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的蛋白與其靶基因的DNA-蛋白復合物,其后續操作同傳統的染色質免疫共沉淀技術(ChIP)。

4.根據權利要求3所述的技術方法,其特征在于步驟(1)構建目的蛋白基因序列連接有3×Flag蛋白標簽序列的真核表達載體(質粒)為:

構建一個真核表達載體,其要求:目的蛋白的N端或C端連接有一小段不超過100bp的3×Flag蛋白標簽序列,構建成功的載體表達后目的蛋白的N端或C端帶有一段很短的Flag蛋白標簽,此Flag蛋白標簽可以與Flag蛋白標簽抗體結合,將目的蛋白沉淀下來。

5.根據權利要求3所述的技術方法,其特征在于步驟(2)將構建好的表達載體(質粒)轉染進特定的細胞系中進行表達為:

選定一種要研究的細胞系,將構建好的真核表達載體瞬時轉染或穩定轉染進細胞內進行表達。

6.根據權利要求3所述的技術方法,其特征在于步驟(3)用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的蛋白與其靶基因的DNA-蛋白復合物為:

用甲醛將細胞交聯,其后再進行超聲打碎基因組,再用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的基因與其靶基因的DNA-蛋白復合物,用特定珠子將復合物拽下,最后解交聯回收得到的微量核酸。

7.根據權利要求2所述的技術方法,本方法的特點在于:

a.提高了傳統ChIP的特異性:由于Flag蛋白標簽抗體與蛋白標簽結合的特異性非常好,所以本方法較傳統ChIP的特異性高,能夠減少非特異的背景,提高可信度;

b.減少了抗體的使用:傳統方法需要大量的目的蛋白抗體來提高特異性,此方法能夠減少抗體的使用,節省了一定的費用。

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