[發明專利]一種利用Flag蛋白標簽沉淀目的蛋白的染色質免疫共沉淀技術無效
| 申請號: | 201310073374.1 | 申請日: | 2013-03-08 |
| 公開(公告)號: | CN103146685A | 公開(公告)日: | 2013-06-12 |
| 發明(設計)人: | 張玉祥;賴瑞 | 申請(專利權)人: | 首都醫科大學 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10;C12N15/79 |
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| 地址: | 100069 北*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 利用 flag 蛋白 標簽 沉淀 目的 染色質 免疫 共沉淀 技術 | ||
1.此項方法是一種利用Flag蛋白標簽沉淀目的蛋白與靶基因的染色質免疫共沉淀(Chromatin?Immunoprecipitation,ChIP)技術,其主要目的是研究轉錄因子,此方法的獨特之處在于:構建一個目的蛋白基因序列連接有Flag蛋白標簽序列的表達載體,將至轉染進特定細胞內,利用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的蛋白與靶基因的DNA-蛋白復合物的染色質免疫共沉淀技術(ChIP)。
2.根據權利要求1所述的技術方法,其特征在于用Flag蛋白標簽抗體替代目的蛋白抗體進行染色質免疫共沉淀(ChIP),它的特點是:a.提高了傳統ChIP的特異性;b.減少了抗體的使用。
3.根據權利要求2所述的技術方法,其特征在于包括以下步驟:
(1)構建目的蛋白基因序列連接有3×Flag蛋白標簽序列的真核表達載體(質粒);
(2)將構建好的表達載體(質粒)轉染進特定的細胞系中進行表達;
(3)用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的蛋白與其靶基因的DNA-蛋白復合物,其后續操作同傳統的染色質免疫共沉淀技術(ChIP)。
4.根據權利要求3所述的技術方法,其特征在于步驟(1)構建目的蛋白基因序列連接有3×Flag蛋白標簽序列的真核表達載體(質粒)為:
構建一個真核表達載體,其要求:目的蛋白的N端或C端連接有一小段不超過100bp的3×Flag蛋白標簽序列,構建成功的載體表達后目的蛋白的N端或C端帶有一段很短的Flag蛋白標簽,此Flag蛋白標簽可以與Flag蛋白標簽抗體結合,將目的蛋白沉淀下來。
5.根據權利要求3所述的技術方法,其特征在于步驟(2)將構建好的表達載體(質粒)轉染進特定的細胞系中進行表達為:
選定一種要研究的細胞系,將構建好的真核表達載體瞬時轉染或穩定轉染進細胞內進行表達。
6.根據權利要求3所述的技術方法,其特征在于步驟(3)用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的蛋白與其靶基因的DNA-蛋白復合物為:
用甲醛將細胞交聯,其后再進行超聲打碎基因組,再用Flag蛋白標簽抗體沉淀目的基因與其靶基因的DNA-蛋白復合物,用特定珠子將復合物拽下,最后解交聯回收得到的微量核酸。
7.根據權利要求2所述的技術方法,本方法的特點在于:
a.提高了傳統ChIP的特異性:由于Flag蛋白標簽抗體與蛋白標簽結合的特異性非常好,所以本方法較傳統ChIP的特異性高,能夠減少非特異的背景,提高可信度;
b.減少了抗體的使用:傳統方法需要大量的目的蛋白抗體來提高特異性,此方法能夠減少抗體的使用,節省了一定的費用。
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