[發(fā)明專利]一種預測放射不良反應相關基因突變檢測芯片

在審

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• 申請日: 2013-02-28
• 公開（公告）號: CN103173543A
• 公開（公告）日: 2013-06-26
• 發(fā)明（設計）人: 郭成賢;尹繼業(yè);裴奇;周伯庭;孟祥光;王瑛;陳娟
• 申請（專利權）人: 中南大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C40B40/06
• 代理公司: 長沙正奇專利事務所有限責任公司 43113
• 代理人: 盧宏

技術領域

本發(fā)明屬于分子生物學技術領域，涉及一種放射不良反應相關基因突變檢測芯片。

背景技術

惡性腫瘤是威脅人類健康的重大慢性疾病。超過一半的腫瘤患者需要進行放射治療，但腫瘤患者放療不良反應個體差異較大。過去解決腫瘤放療不良反應個體差異，集中在放療手段或技術的提高。隨著分子生物學的發(fā)展及人類基因組計劃的完成，尤其是藥物基因組學和放射基因組學的發(fā)展，使從分子基因水平尋找腫瘤放療不良反應個體差異的原因成為研究熱點。研究發(fā)現一些基因或蛋白與腫瘤放療不良反應密切相關，包括癌基因、抑癌基因、細胞周期蛋白、細胞凋亡基因、生長因子、DNA修復基因等。檢測放射治療不良反應個體差異的腫瘤生物遺傳標志物，以便在放療前對不良反應進行預測和評估，將有利于臨床醫(yī)生制定放療的個體化治療方案。

生物芯片技術始于上世紀80年代末和90年代初南點雜交發(fā)明人Dr.Sountern研發(fā)的反向南點雜交實驗。生物芯片產業(yè)技術主要涉及到生物芯片制備、生物芯片應用、生物芯片信息處理分析等方面。生物芯片技術已成為高效、大規(guī)模獲取相關信息的重要手段。目前生物芯片技術已廣泛應用于分子生物學研究、疾病的預防診斷與治療、新藥研發(fā)、司法鑒定、環(huán)境污染監(jiān)測和食品衛(wèi)生監(jiān)督等諸多領域。

本發(fā)明采用生物芯片技術檢測與放射治療不良反應相關的基因突變位點，提前預測放射治療可能引起的不良反應，將有利于臨床醫(yī)生個體化選擇放療方案，使患者治療利益最大化。

發(fā)明內容

本發(fā)明旨在針對目前在腫瘤放射治療過程中，出現對放療不良反應個體差異的預測。提供一種方便、快捷的輔助臨床醫(yī)生制定個體化放療相關基因型診斷芯片。

為了達到上述目的，本發(fā)明提供的技術方案為：

一種預測放射不良反應相關基因突變檢測芯片，包括固相基片和點載在固相基片上的基因探針陣列；所述基因探針含有與放射不良反應相關基因突變位點的互補寡核苷酸序列；所述不良反應相關基因突變位點是TGFB1?rs1800469，SOD2?rs4880，XRCC1rs25487，XRCC3?rs861539，ATM?rs1801673，TP53?rs1042522和NOS3?rs1799983。所述TGFB1，SOD2，XRCC1，XRCC3，ATM，TP53和NOS3的序列如SEQ?ID?NO.1-7所示。

其中，所述基因探針包括野生型基因探針和突變型基因探針，基因探針長度為17-22bp；具體而言，所述基因探針包括：

TGFB1?rs1800469野生型探針5′-CAGGGTCAGTGCCGTAAT-3′

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TGFB1?rs1800469突變型探針5′-TACTGTCAAAATGCCGCT-3′

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SOD2?rs4880野生型探針5′-GTCCTCGGGGTAATACATCCAA-3′

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SOD2?rs4880突變型探針5′-GAAGGTTTTCGGCAGACGTGAC-3′

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XRCC1?rs25487野生型探針5′-CTTGTCAACATAGGATCAT-3′

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XRCC1?rs25487突變型探針5′-TGGCTGCAAAATGCGATCT-3′

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XRCC3?rs861539野生型探針5′-ATGGGCCCACTGTGTTATTT-3′

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XRCC3?rs861539突變型探針5′-CCCTGAGATTACGGCTTAAA-3′

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