[發(fā)明專利]一種預(yù)測放射不良反應(yīng)相關(guān)基因突變檢測芯片

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201310062989.4
• 申請日: 2013-02-28
• 公開（公告）號(hào): CN103173543A
• 公開（公告）日: 2013-06-26
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 郭成賢;尹繼業(yè);裴奇;周伯庭;孟祥光;王瑛;陳娟
• 申請（專利權(quán)）人: 中南大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;C40B40/06
• 代理公司: 長沙正奇專利事務(wù)所有限責(zé)任公司 43113
• 代理人: 盧宏

1.一種預(yù)測放射不良反應(yīng)相關(guān)基因突變檢測芯片，包括固相基片和點(diǎn)載在固相基片上的基因探針陣列，其特征在于，所述基因探針含有與放射不良反應(yīng)相關(guān)基因突變位點(diǎn)的互補(bǔ)寡核苷酸序列；所述不良反應(yīng)相關(guān)基因突變位點(diǎn)是TGFB1?rs1800469，SOD2?rs4880，XRCC1?rs25487，XRCC3?rs861539，ATM?rs1801673，TP53?rs1042522和NOS3rs1799983。

2.如權(quán)利要求1所述的芯片，其特征在于，所述基因探針包括野生型基因探針和突變型基因探針，基因探針長度為17-22bp。

3.如權(quán)利要求1所述的芯片，其特征在于，所述基因探針包括：

TGFB1?rs1800469野生型探針??5′-CAGGGTCAGTGCCGTAAT-3′

TGFB1?rs1800469突變型探針??5′-TACTGTCAAAATGCCGCT-3′

SOD2?rs4880野生型探針??????5′-GTCCTCGGGGTAATACATCCAA-3′

SOD2?rs4880突變型探針??????5′-GAAGGTTTTCGGCAGACGTGAC-3′

XRCC1?rs25487野生型探針????5′-CTTGTCAACATAGGATCAT-3′

XRCC1?rs25487突變型探針????5′-TGGCTGCAAAATGCGATCT-3′

XRCC3?rs861539野生型探針???5′-ATGGGCCCACTGTGTTATTT-3′

XRCC3?rs861539突變型探針???5′-CCCTGAGATTACGGCTTAAA-3′

ATM?rs1801673野生型探針????5′-TTGAGCTCCATTGGTCAT-3′

ATM?rs1801673突變型探針????5′-TCAGACTGGTTCTCTAGT-3′

TP53?rs1042522野生型探針???5′-ACATACGTGTGCGAGGA-3′

TP53?rs1042522突變型探針???5′-ATATGAACGATGCAACA-3′

NOS3?rs1799983野生型探針???5′-AATCAACTTACTGTAAACTTG-3′

NOS3?rs1799983突變型探針???5′-AATGAGTCGCCTCCTACTAGC-3′

4.如權(quán)利要求3所述的芯片，其特征在于，所述基因探針還包括陽性參照探針5′-ACTCTAAGTGCTATGCC-3′。

5.如權(quán)利要求1所述的芯片，其特征在于，所述固相基片材料為硅片、玻璃片、塑料片或尼龍膜中的一種或它們的任意組合。

6.如權(quán)利要求1所述的芯片，其特征在于，所述基因探針及固相基片表面包被多聚賴氨酸或瓊脂糖。

7.如權(quán)利要求1所述的芯片，其特征在于，所述基因探針及固相基片表面修飾有氨基或醛基。