[發(fā)明專利]兔出血癥病毒RT-PCR檢測方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310052271.7 | 申請日: | 2011-03-15 |
| 公開(公告)號: | CN103146842A | 公開(公告)日: | 2013-06-12 |
| 發(fā)明(設計)人: | 賈廣樂;蘇國清;林祥梅;武昱孜;孫衛(wèi)東 | 申請(專利權)人: | 中國檢驗檢疫科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產權代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飛;張慶敏 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 出血 病毒 rt pcr 檢測 方法 | ||
本申請是申請日為2011年3月15日,申請?zhí)枮椋?01110062529.2,發(fā)明名稱為“兔出血癥病毒熒光定量RT-PCR檢測方法”的專利申請之分案申請。
技術領域
本發(fā)明涉及一種兔出血癥病毒的分子檢測方法,具體地說,涉及一種兔出血癥病毒熒光定量RT-PCR檢測方法,其屬于生物技術領域。
背景技術
兔出血癥(Rabbit?hemorrhagic?disease,RHD)是由兔出血癥病毒(Rabbit?hemorrhagic?disease?virus,RHDV)引起的一種高度接觸烈性傳染病,傳播快,發(fā)病急,發(fā)病率和致死率都很高,以呼吸系統(tǒng)出血、肝壞死、實質臟器水腫、淤血及出血性變化為特征,是兔的一種毀滅性傳染病,目前所有已測的兔的品種都表現出易感性。自然條件下,RHDV主要侵害成年兔,2月齡以下的仔兔自然感染時一般不發(fā)病。該病對養(yǎng)兔業(yè)造成巨大的經濟損失,也嚴重威脅瀕臨滅絕的野兔品種。由此,RHDV引起了國內外學者高度重視,從形態(tài)學、生物化學和分子生物學等各個方面系統(tǒng)的研究該病毒。
RHDV在國際病毒分類委員會(ICTV)2000年最新的第七次報告中被列入新成立的杯狀病毒科(Caliciviridae)兔病毒屬(Lagovirus)。RHDV為單股正鏈RNA病毒,其基因組由7437個核苷酸組成,分子量為2.4×106-2.6×106,5’端沒有帽狀結構,而是共價結合與感染相關的Vpg(virion?protein,genome?linked)蛋白,3’末端具有一個短的PolyA尾。第1-9nt為5’非編碼區(qū),最后59nt為3’非編碼區(qū),含有兩個開放閱讀框架(ORF),第10-7044nt為ORFl編碼的一個含有2344個氨基酸的多聚蛋白,該多聚蛋白經蛋白水解酶加工成主要衣殼蛋白VP60以及包括RNA聚合酶和蛋白酶在內的三個非結構蛋白。根據分析,該病毒的RNA基因組結構與同科的貓嵌杯樣病毒不一樣,僅含有兩個開放閱讀框。
RHDV的免疫原性蛋白、衣殼蛋白VP60,在誘導抗病毒感染的免疫反應中起重要作用,是病毒免疫保護性抗原。VP60基因全長1740bp,在病毒誘導機體的免疫反應中起主要作用,其核苷酸極端保守。RHDV是一種急性、高度致死性RNA病毒,在兔體內停留時間短,沒有足夠的時間讓病毒發(fā)生有利于進化的變異,因此幾十年中RHDV仍然能保持高序列同源性。
目前,已有將分子生物學應用到RHDV診斷中的研究,其主要包括玻片凝集試驗(SHA)檢測RHDV、酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)檢測RHDV、RT-PCR檢測RHDV等,但上述這些方法存在敏感性低、可重復性差、結果判定易受多種因素影響、處理耗時多等問題。
熒光定量PCR(fluorescence?quantitative?polymerase?chain?reaction),又稱實時定量(real-time?quantitative)PCR。這種技術是在PCR技術基礎上發(fā)展起來的高度靈敏的核酸定量技術。它是一種在PCR體系中引入了熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,使PCR擴增和終產物檢測全處在封閉的條件下進行,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析方法,具有實時監(jiān)測、無污染、快速、靈敏、精確、特異等特點,極大的克服了傳統(tǒng)PCR技術普遍存在的假陽性及不能定量等問題,其最主要的優(yōu)勢是能對待測樣本起始PCR反應模板進行準確定量,擴大了PCR的應用范圍,使得PCR技術更廣泛的應用于臨床,在監(jiān)測患者病情、預后、指導用藥等方面。目前已廣泛應用于分子生物學研究和醫(yī)學研究等領域。
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