[發(fā)明專(zhuān)利]氟喹諾酮類(lèi)藥物的藥效預(yù)測(cè)模型的應(yīng)用有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201310048650.9 | 申請(qǐng)日: | 2013-02-06 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN103077328A | 公開(kāi)(公告)日: | 2013-05-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 李燕;孫鶴 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 天津大學(xué) |
| 主分類(lèi)號(hào): | G06F19/00 | 分類(lèi)號(hào): | G06F19/00 |
| 代理公司: | 天津市北洋有限責(zé)任專(zhuān)利代理事務(wù)所 12201 | 代理人: | 杜文茹 |
| 地址: | 300072*** | 國(guó)省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 喹諾酮類(lèi) 藥物 藥效 預(yù)測(cè) 模型 應(yīng)用 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種藥效預(yù)測(cè)模型。特別是涉及一種氟喹諾酮類(lèi)藥物的藥效預(yù)測(cè)模型的應(yīng)用。
背景技術(shù)
氟喹諾酮類(lèi)藥物是第三大類(lèi)抗菌藥物,具有活性較強(qiáng)、抗菌譜廣、生物利用度高的特點(diǎn)。為了縮短研發(fā)周期、節(jié)約成本,基于模型的藥物研發(fā)模式貫穿了目前的氟喹諾酮類(lèi)藥物的研發(fā)過(guò)程。
氟喹諾酮類(lèi)藥物在研發(fā)初期的篩選或結(jié)構(gòu)優(yōu)化時(shí)常用的方法是定量構(gòu)效關(guān)系模型。定量構(gòu)效關(guān)系研究的是化合物的結(jié)構(gòu)信息與活性之間的相關(guān)關(guān)系,并用結(jié)構(gòu)信息預(yù)測(cè)化合物的活性。Kumar等建立了含C-7哌嗪基的氟喹諾酮針對(duì)金黃色葡萄球菌MTCC1430、枯草桿菌MTCC2423、大腸桿菌MTCC739的定量構(gòu)效關(guān)系模型。Abdel-Aziz等用建立了含砷磺酰基的氟喹諾酮針對(duì)金黃色葡萄球菌ATCC29213、枯草桿菌ATCC10400、大腸桿菌ATCC25922、銅綠假單胞菌ATCC27853的定量構(gòu)效關(guān)系模型。此類(lèi)研究活性的指標(biāo)大部分為log(1/MIC),只考慮了藥物的抗菌作用,并沒(méi)有考慮藥物在體內(nèi)的藥代動(dòng)力學(xué),更沒(méi)有考慮其體內(nèi)藥效。
在臨床試驗(yàn)過(guò)程中,藥效模型經(jīng)常用來(lái)尋找最優(yōu)劑量、比較治療方案間的藥效、選擇給藥方案、尋找fAUC/MIC的閾值等。Stergiopoulou等人用sigmoid?Emax模型考察脫氧膽酸鹽兩性霉素B、環(huán)丙沙星、人中性粒細(xì)胞之間的相互作用。Andraud等人用time-kill曲線預(yù)測(cè)了馬波沙星對(duì)中度耐藥的大腸桿菌隨時(shí)間的殺菌效果。這些藥效模型信息量大,可以為臨床給藥方案提供參考,但是并沒(méi)有與結(jié)構(gòu)相結(jié)合,無(wú)法說(shuō)明哪些結(jié)構(gòu)影響了臨床療效,因此無(wú)法用在藥物篩選或結(jié)構(gòu)優(yōu)化等研發(fā)初期,使大量的已開(kāi)發(fā)的氟喹諾酮藥物的藥效信息無(wú)法得到應(yīng)用。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是,提供一種能夠預(yù)測(cè)針對(duì)金黃色葡萄球菌ATCC29213、糞腸球菌ATCC29212、大腸桿菌ATCC25922、銅綠假單胞菌ATCC27853的fAUC24/MIC及平均水平的fAUC24/MIC以及服用氟喹諾酮類(lèi)藥物后體溫下降趨勢(shì)的氟喹諾酮類(lèi)藥物的藥效預(yù)測(cè)模型的應(yīng)用。
本發(fā)明所采用的技術(shù)方案是:一種氟喹諾酮類(lèi)藥物的藥效預(yù)測(cè)模型的應(yīng)用,包括如下步驟:
1)用Accelrys?Discovery?Studio軟件計(jì)算新氟喹諾酮的分子描述符;
2)根據(jù)分子描述符選出4個(gè)細(xì)菌特異的藥動(dòng)-藥效指標(biāo)預(yù)測(cè)模型;選出1個(gè)細(xì)菌通用的定量構(gòu)效關(guān)系模型;選出1個(gè)藥效-結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型;
3)用杠桿值檢驗(yàn)判斷需要預(yù)測(cè)的新氟喹諾酮是否在杠桿值的預(yù)測(cè)范圍3*p/n之內(nèi);
4)如果新氟喹諾酮在杠桿值的預(yù)測(cè)范圍3*p/n之內(nèi),則用步驟1)中的分子描述符代入步驟2)中的4個(gè)細(xì)菌特異的藥動(dòng)-藥效指標(biāo)預(yù)測(cè)模型和細(xì)菌通用的定量構(gòu)效關(guān)系模型預(yù)測(cè)金黃色葡萄球菌ATCC29213、糞腸球菌ATCC29212、大腸桿菌ATCC25922、銅綠假單胞菌ATCC27853的fAUC24/MIC及平均水平的fAUC24/MIC。
5)將不同初始體溫、劑量代入步驟2)中的藥效-結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型中預(yù)測(cè)體溫隨治療天數(shù)變化的趨勢(shì)。
步驟1)所述的分子描述符包括CHI_3_CH、CHI_V_0、IAC_mean、Zagreb、Num_Rings6、LogD、E_ADJ_mag、CHI_3_P和Num_H_Donors。
步驟2)所述的4個(gè)細(xì)菌特異的藥動(dòng)-藥效指標(biāo)預(yù)測(cè)模型是:
金黃色葡萄球菌ATCC29213:Log10fAUC24/MIC=-11.476+2.317*CHI_3_CH+0.396*CHI_V_0+3.928*IAC?Mean;
糞腸球菌ATCC29212:Log10fAUC24/MIC=-4.061+0.0327*Zagreb+1.492*<2.590-Num_Rings6>;
大腸桿菌ATCC25922:fAUC24/MIC=-2564.696+1367.216*CHI_3_CH+1416.158*IAC_Mean+14.623*Num_Rings62+24.301*LogD;
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G06F19-14 ..用于發(fā)展或進(jìn)化的,例如:進(jìn)化的保存區(qū)域決定或進(jìn)化樹(shù)結(jié)構(gòu)
G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的,例如:結(jié)構(gòu)排序,結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系,蛋白質(zhì)折疊,結(jié)構(gòu)域拓?fù)洌媒Y(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶,涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的,例如:基因型–表型關(guān)聯(lián),不均衡連接,種群遺傳學(xué),結(jié)合位置鑒定,變異發(fā)生,基因型或染色體組的注釋?zhuān)鞍踪|(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用
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