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[發明專利]亞歷山大病相關基因突變、其檢測方法及其用途有效

專利信息
申請號: 201310047545.3 申請日: 2013-02-06
公開(公告)號: CN103966226A 公開(公告)日: 2014-08-06
發明(設計)人: 方明艷;蓋齊·達尼埃萊;王海榮;劉軒竹;王俊;汪建;楊煥明 申請(專利權)人: 深圳華大基因研究院
主分類號: C12N15/12 分類號: C12N15/12;C12N15/11;C12Q1/68;C07K14/47
代理公司: 北京北翔知識產權代理有限公司 11285 代理人: 張廣育;姜建成
地址: 518083 廣東*** 國省代碼: 廣東;44
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摘要:
搜索關鍵詞: 亞歷山大 相關 基因突變 檢測 方法 及其 用途
【說明書】:

技術領域

發明涉及遺傳神經疾病領域,具體而言涉及亞歷山大病。

背景技術

亞歷山大病是一種罕見的致命性的遺傳神經性退化疾病。1949年由亞歷山大首先提出此病,是一種由于星型膠質細胞功能異常導致的腦白質營養不良性疾病。典型病例表現為以額葉為主的白質異常和巨腦,組織學檢測顯示腦內存在Rosenthal纖維,為中間絲等幾種類型細胞細胞骨架的組成部分,包括中樞神經系統星形膠質細胞和室管膜細胞。亞歷山大病的診斷標準:以額葉為主的廣泛腦白質異常;腦室周緣T1加權像呈高信號而T2加權像呈低信號;基底節和丘腦異常;腦干異常,特別累及了中腦和延髓;一個或多個結構(包括腦室周緣、額葉白質、視交叉、穹隆、基底節、丘腦、齒狀核和腦干)的對比強化。以上5條標準符合4條即可確診。

亞歷山大病的遺傳方式尚不十分清楚,多為散發病例,也有一些家系報道,可能為常染色體顯性遺傳。根據發病年齡及臨床表現的不同,通??煞譃閶雰盒汀⑶嗄晷秃统赡晷汀雰盒?,目前為最常見類型,多在2歲以內起病,表現為智力發育遲緩、肢無力、肌張力降低、吸吮、飲水困難、構音不清、小腦性共濟失調,70%的患者有癲癇發作、巨腦。嬰兒型亞歷山大病的病情嚴重,常在10歲前死亡。青年型,比嬰兒型少見,在4-14歲起病,男女均可發病臨床特征與嬰兒型有很多相似處,不同點為少見癲癇發作、巨腦表現。青年型亞歷山大病的病情發展相對緩慢。成年型,罕見,在20-70歲起病,男女均可發病,首先表現為下丘腦、腦干和脊髓受損的癥狀。成年型亞歷山大病的病情進展緩慢,臨床上不易與多發性硬化相鑒別。研究表明,雖然各種類型亞歷山大病的臨床表型不同,但是截止到目前發現的各種類型亞歷山大病的大部分病例均為GFAP基因突變,但是也有部分確診為亞歷山大病患者中并沒有發現GFAP基因突變。另外,2%存在GFAP基因突變的人表型正常。對于GFAP基因突變的病例,相同的GFAP突變位點,男女患者臨床癥狀不同,這提示性別可能會影響亞歷山大疾病的發展程度。對于GFAP基因突變的家系病例,相同的GFAP基因突變位點,但是家系內患者臨床癥狀不同,這提示可能存在修飾基因或者其他因素導致患者的臨床特性不一致。

因此,有必要深入研究亞歷山大病的遺傳機制。而且,本領域仍然需要發現亞歷山大病相關的基因突變,以及檢測亞歷山大病的方法。

發明內容

本發明涉及到的一個患病家系,兩個患者,同母異父,父母正常。兩名患者臨床表型不一致,而影像學MRI檢測發現兩名患者均具有成年型亞歷山大疾病的特征。

本發明人經過不懈的努力,發現了亞歷山大病基因的新突變,并由此提供了下述發明:

本發明涉及亞歷山大病基因新的突變,具體為:GFAP基因c.1289G>A(p.R430H);HDAC6基因c.2566C>T(p.P856S),其中GFAP蛋白突變p.R430H發生在GFAP-ε上。

在第一方面,本發明涉及亞歷山大病的生物標記物,即突變的GFAP和/或HDAC6基因或蛋白,所述生物標記物是具有選自如下的突變基因或蛋白:

GFAP基因c.1289G>A(p.R430H);和/或

HDAC6基因c.2566C>T(p.P856S)。

在一個實施方案中,本發明的突變GFAP基因分別為具有以下突變的SEQ ID NO:1:c.1289G>A。

在一個實施方案中,本發明的突變HDAC6基因分別為具有以下突變的SEQ ID NO:2:c.2566C>T。

在一個實施方案中,本發明的突變的GFAP-ε蛋白為具有以下突變的SEQ ID NO:3:p.R430H。

在一個實施方案中,本發明的突變的HDAC6蛋白為具有以下突變的SEQ ID NO:4:p.P856S。

在第二方面,本發明涉及一種檢測亞歷山大病的方法,所述方法包括檢測受試者的GFAP和/或HDAC6基因或蛋白中是否存在突變位點,如果有突變位點,則所述受試者被鑒定為患有亞歷山大病或易患亞歷山大病,或者其后代會患有亞歷山大病或易患亞歷山大病,所述突變位點選自如下任一種或其組合:

GFAP基因c.1289G>A(p.R430H);和/或

HDAC6基因c.2566C>T(p.P856S)。

在一個實施方案中,GFAP基因為SEQ ID NO:1的序列表示。

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