[發(fā)明專利]SLC24A5基因突變體及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201310016429.5
• 申請(qǐng)日: 2013-01-16
• 公開（公告）號(hào): CN103923926A
• 公開（公告）日: 2014-07-16
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 戴蘭蘭;劉軒竹;李巍;魏愛華
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 深圳華大基因研究院
• 主分類號(hào): C12N15/12
• 分類號(hào): C12N15/12;C12Q1/68;C12M1/34;C12M1/00;C07K14/47
• 代理公司: 北京清亦華知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11201
• 代理人: 李志東

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及SLC24A5基因突變體及其應(yīng)用。具體地，本發(fā)明涉及分離的編碼SLC24A5突變體的核酸、分離的多肽、篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的方法、篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的系統(tǒng)以及用于篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的試劑盒。

背景技術(shù)

眼皮膚白化病（OCA）是一種異質(zhì)的常染色體隱性遺傳病，在全世界的流行率約為1:17000。此病表現(xiàn)為皮膚、頭發(fā)和眼的黑色素減少或完全喪失，通常伴隨著畏光、斜視、中毒或嚴(yán)重的視覺缺陷、眼球震顫等眼科癥狀。目前，已知的人類OCA的致病基因有非綜合征型OCA基因（TYR,OCA2,TYRP1和SLC45A2）和綜合征型OCA基因（HPS1,AP3B1,HPS3,HPS4,HPS5,HPS6,DTNBP1,BLOC1S3,PLDN,LYST,MYO5A,RAB27A和MLPH），但仍有多個(gè)眼皮膚白化病患者可能由其他的未知基因致病。

因而，目前對(duì)眼皮膚白化病的研究仍有待深入。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明旨在至少解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的技術(shù)問題之一。為此，本發(fā)明的一個(gè)目的在于提出人類眼皮膚白化病的新的致病基因及其突變。

本發(fā)明是基于發(fā)明人的下列工作而完成的：發(fā)明人通過全外顯子組測(cè)序結(jié)合Sanger驗(yàn)證的方法確定了眼皮膚白化病的新的致病基因及致病突變。

根據(jù)本發(fā)明的第一方面，本發(fā)明提出了一種分離的編碼SLC24A5突變體的核酸。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，與SEQ?ID?NO：1相比，該核酸具有選自下列的至少一種突變：c.591G>A和c.1361insT。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，發(fā)明人確定了多個(gè)SLC24A5基因的突變體，這些突變體與眼皮膚白化病的發(fā)病密切相關(guān)，從而通過檢測(cè)這些突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測(cè)生物樣品是否易感眼皮膚白化病。

根據(jù)本發(fā)明的第二方面，本發(fā)明提出了一種分離的多肽。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，與SEQ?ID?NO：2相比，該分離的多肽具有選自下列的至少一種突變：p.W197X和p.L454Ffs31X。根據(jù)本發(fā)明的一些具體示例，該多肽是由前述分離的編碼SLC24A5突變體的核酸編碼的。通過檢測(cè)生物樣品中是否表達(dá)該多肽，可以有效地檢測(cè)生物樣品是否易感眼皮膚白化病。

根據(jù)本發(fā)明的第三方面，本發(fā)明提出了一種篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的方法。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的方法包括以下步驟：從生物樣品提取核酸樣本；確定核酸樣本的核酸序列；該核酸樣本的核酸序列或其互補(bǔ)序列與SEQ?ID?NO：1相比，具有選自c.591G>A和c.1361insT的至少一種突變是生物樣品易感眼皮膚白化病的指示。通過根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的方法，可以有效地篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品。

根據(jù)本發(fā)明的第四方面，本發(fā)明提出了一種篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的系統(tǒng)。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的系統(tǒng)包括：核酸提取裝置，該核酸提取裝置用于從生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，該核酸序列確定裝置與核酸提取裝置相連，用于對(duì)核酸樣本進(jìn)行分析，以便確定核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，該判斷裝置與核酸序列確定裝置相連，以便基于核酸樣本的核酸序列或其互補(bǔ)序列與SEQ?ID?NO：1相比，是否具有選自c.591G>A和c.1361insT的至少一種突變，判斷生物樣品是否易感眼皮膚白化病。利用該系統(tǒng)，能夠有效地實(shí)施前述篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品。

根據(jù)本發(fā)明的第五方面，本發(fā)明提出了一種用于篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的試劑盒。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該用于篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品的試劑盒包括：適于檢測(cè)SLC24A5基因突變體的試劑，其中與SEQ?ID?NO：1相比，SLC24A5基因突變體具有選自c.591G>A和c.1361insT的至少一種突變。利用根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的試劑盒，能夠有效地篩選易感眼皮膚白化病的生物樣品。

本發(fā)明的附加方面和優(yōu)點(diǎn)將在下面的描述中部分給出，部分將從下面的描述中變得明顯，或通過本發(fā)明的實(shí)踐了解到。

附圖說明

本發(fā)明的上述和/或附加的方面和優(yōu)點(diǎn)從結(jié)合下面附圖對(duì)實(shí)施例的描述中將變得明顯和容易理解，其中：