[發(fā)明專利]基于多基因的丙型流感病毒實時熒光定量RT-PCR檢測試劑有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210573171.4 | 申請日: | 2012-12-25 |
| 公開(公告)號: | CN103103287A | 公開(公告)日: | 2013-05-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 藍(lán)雨;王大燕;舒躍龍 | 申請(專利權(quán))人: | 中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京輕創(chuàng)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11212 | 代理人: | 楊立 |
| 地址: | 102206 北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 基于 多基因 流感病毒 實時 熒光 定量 rt pcr 檢測 試劑 | ||
1.基于多基因的丙型流感病毒實時熒光定量RT-PCR檢測引物和探針,包括丙型流感病毒特異性引物和探針,其特征在于,
所述丙型流感病毒特異性引物和探針包括丙型流感病毒HE基因特異性引物和探針、丙型流感病毒NP基因特異性引物和探針、丙型流感病毒MP基因特異性引物和探針及丙型流感病毒NS基因特異性引物和探針中的一種或任意幾種;
所述丙型流感病毒特異性引物和探針針對流感病毒HE基因相對保守區(qū)域、丙型流感病毒NP基因相對保守區(qū)、針對丙型流感病毒MP基因相對保守區(qū)和/或針對丙型流感病毒NS基因相對保守區(qū);
所述丙型流感病毒特異性引物和探針是長度為18~27bp的寡核苷酸片段;
其中,針對HE基因和MP基因的探針與目的基因負(fù)鏈的堿基序列一致,針對NP基因和NS基因的探針與目的基因正鏈的堿基序列一致。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述基于多基因的丙型流感病毒實時熒光定量RT-PCR檢測引物和探針,其特征在于,
所述丙型流感病毒HE基因特異性引物和探針為:
正向引物(SEQ?ID?NO.1):5'-YGGAGGAAATTTRTATGC-3',
反向引物(SEQ?ID?NO.2):5'-GCCRATCCATGTACTTTG-3',
探針(SEQ?ID?NO.3):5'-FAM-TTCAAGACRGARGCTCCAGC-BHQ1-3';
所述丙型流感病毒NP基因特異性引物和探針為:
正向引物(SEQ?ID?NO.4):5'-RAGGGAAAAGAAAGCAAG-3',
反向引物(SEQ?ID?NO.5):5'-CTGCRTGGTAGGTTATATTG-3',
探針(SEQ?ID?NO.6):5'-FAM-AGCRGACAGYAACTTCAACGC-BHQ1-3';
丙型流感病毒MP基因特異性引物和探針為:
正向引物(SEQ?ID?NO.7):5'-GACCACAATTATGCCTGAA-3',
反向引物(SEQ?ID?NO.8):5'-TGGTGAGTTGTCGGTTTC-3',
探針(SEQ?ID?NO.9):5'-FAM-TCTCCCAGGTCAAGTCTCTCCC-BHQ1-3';
丙型流感病毒NS基因特異性引物和探針為:
正向引物(SEQ?ID?NO.10):5'-CGTAGAAATGAAGGGRAAG-3',
反向引物(SEQ?ID?NO.11):5'-CTCCACGATGATGATACA-3',
探針(SEQ?ID?NO.12):5'-FAM-CTCCAAGCAACATAGCACCAATT-BHQ1-3'。
3.基于多基因的丙型流感病毒實時熒光定量RT-PCR檢測試劑盒,包括檢測溶液,其特征在于,所述檢測溶液包括權(quán)利要求1或2所述的丙型流感病毒HE基因特異性引物和探針、丙型流感病毒NP基因特異性引物和探針、丙型流感病毒MP基因特異性引物和探針及丙型流感病毒NS基因特異性引物和探針中的一種或任意幾種。
4.基于多基因的丙型流感病毒實時熒光定量RT-PCR檢測方法,包括以下步驟:
(1)利用核酸提取試劑從待測樣本中提取流感病毒RNA,得到流感病毒RNA溶液;
(2)反應(yīng)體系:總體積25ul,取5ul步驟(1)制得的病毒RNA溶液,12.5ul2×RT-PCR?Buffer,1ul25×RT-PCR?Enzyme?Mix,加入針對丙型流感病毒HE基因和/或丙型流感病毒NP基因和/或丙型流感病毒MP基因和/或丙型流感病毒NS基因的檢測上游引物分別為0.5uL及下游引物分別為0.5uL,濃度均分別為40uM和探針0.5uL,濃度均分別為20uM,RNase?Free?H2O加至25ul;
(3)步驟(2)反應(yīng)體系按下述條件進(jìn)行rRT-PCR檢測:
45℃/10min,1個循環(huán),95℃/10min,1個循環(huán),95°/15s,60°/45s,40個循環(huán);每次循環(huán)的退火時收集熒光,檢測結(jié)果,根據(jù)擴增曲線和Ct判定結(jié)果。
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