[發明專利]常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片

無效

• 申請號: 201210570393.0
• 申請日: 2012-12-25
• 公開（公告）號: CN103898197A
• 公開（公告）日: 2014-07-02
• 發明（設計）人: 郜恒駿;張可浩;張新;盛海輝
• 申請（專利權）人: 泰州醫藥城博奧邦科生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C40B40/06
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明涉及一常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片，特別是涉及一種惡性腫瘤易感性測評及套組方法。?

背景技術

2008年，全球有1270萬人患癌，死亡人數高達760萬。世界范圍內因惡性腫瘤死亡的人數，比艾滋病、瘧疾和結核病加起來還要多。如果不采取有效措施，預計到2030年，每年將出現2600萬新增惡性腫瘤病例，惡性腫瘤死亡人數將達到1700萬，中低收入國家將成為惡性腫瘤肆虐的“重災區”。?

近幾年腫瘤的發病率和死亡率居高不下，就我國而言，惡性腫瘤已成為居民的第二位死因，城市居民的首位死因。在全球范圍內，我國的惡性腫瘤發病率與美國、英國、法國接近，高于多數亞洲國家。肺癌、肝癌、結直腸癌、乳腺癌、膀胱癌死亡率及其構成呈明顯上升趨勢，其中肺癌和乳腺癌上升幅度最大，肺癌已代替肝癌成為我國首位惡性腫瘤死亡原因（占全部惡性腫瘤死亡的22.7%）。?

已經掌握了關于惡性腫瘤病因及預防和管理惡性腫瘤的干預措施的大量知識。通過實施以證據為基礎的惡性腫瘤預防、早期發現和惡性腫瘤患者管理戰略，可使惡性腫瘤得以減少和控制。?

煙草使用、飲酒、不健康的飲食以及缺乏運動是全世界惡性腫瘤的主要危險因素。同時遺傳因素也是惡性腫瘤一個重要危險因素。因外部環境我們可以掌控，而內部因素－遺傳因素（易感基因）我們是無法掌控。因此要從根本上預防惡性腫瘤的發生、延緩惡性腫瘤的發展和制訂合理的疾病治療措施，就必須檢測這些疾病的易感基因。基因檢測的積極意義體現在癌癥發生之前就可以發現潛在的風險，從而提起人們對自身健康與疾病的關注，進而通過“個性化健康管理”指導受檢者采取有效的方法預防。?

發明內容

本發明要解決的技術問題是提供常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片，通過對這些基因中的關鍵性基因遺傳位點進行檢測，判斷具體基因型，能夠評估個體患上惡性腫瘤的風險幾率，從而對加強惡性腫瘤防治起到積極作用。?

為解決上述技術問題，本發明的常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片，包括步驟：?

1）提取受檢者樣本DNA；?

2）對樣本DNA進行遺傳變異的PCR擴增、純化、片段化及熒光素標記，所述遺傳變異包括：rs505922、rs2294008、rs2279744、rs738409、rs2274223、rs667282、rs6983267和rs2231142。?

3）熒光素標記的PCR產物進行基因芯片雜交，檢測遺傳變異，所述遺傳變異包括：rs505922、rs2294008、rs2279744、rs738409、rs2274223、rs667282、rs6983267和rs2231142。?

4）根據步驟3）得到的基因分型結果，分析受檢者腫瘤個性化治療的療效。?

所述步驟2）中的rs505922的引物是SEQ?ID?NO:1～2所示序列的引物、rs2294008的引物是SEQ?ID?NO:3～4所示序列的引物、rs2279744的引物是SEQ?ID?NO:5～6所示序列的引物、rs738409的引物是SEQ?ID?NO:7～8所示序列的引物、rs2274223的引物是SEQ?ID?NO:9～10所示序列的引物、rs667282的引物是SEQ?ID?NO:11～12所示序列的引物、rs6983267的引物是SEQ?ID?NO:13～14所示序列的引物、rs2231142的引物是SEQ?ID?NO:15～16所示序列的引物。?

所述步驟2）中的片段化是將純化的PCR產物經測定濃度后，用DNase?I進行片段化；所述熒光素標記是將片段化PCR產物利用脫氧核苷酸轉移酶在3’末端進行熒光素標記。?

所述步驟3）基因芯片的制備是將預先設計并合成好的探針通過接觸式點樣或噴墨式點樣點載到玻片或硅片材質的固相載體片基上，其中，探針是SEQ?ID?NO:17～SEQ?ID?NO:32所示序列的DNA探針。?

本發明中的基因和SNP位點的理論依據：?

rs505922與人體的ABO血型相關，而人體ABO血型與胰腺癌相關。?

rs2294008是PTSA基因上的多態性位點，PTSA是前列腺癌標志性基因。今年來的研究發現這個基因也與其它多種腫瘤的發生相關。?

rs2279744是MDM2基因上的一個多態性位點。MDM2是P53抑癌基因調控網絡中一員，其功能異常幾乎與所有癌癥發生發展相關。?

rs738409是PNPLA3基因上的一個多態性位點。PNPLA3功能異常與肝硬化和肝癌相關。?