[發明專利]常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片無效
| 申請號: | 201210570393.0 | 申請日: | 2012-12-25 |
| 公開(公告)號: | CN103898197A | 公開(公告)日: | 2014-07-02 |
| 發明(設計)人: | 郜恒駿;張可浩;張新;盛海輝 | 申請(專利權)人: | 泰州醫藥城博奧邦科生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C40B40/06 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 225300 江蘇省*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 常見 惡性腫瘤 基因 檢測 芯片 | ||
1.常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片,包括步驟:
1)提取受檢者樣本DNA;
2)對樣本DNA進行遺傳變異的PCR擴增、純化、片段化及熒光素標記,所述遺傳變異包括:rs505922、rs2294008、rs2279744、rs738409、rs2274223、rs667282、rs6983267和rs2231142;
3)熒光素標記的PCR產物進行基因芯片雜交,檢測目的基因的SNP位點;
4)根據步驟3)得到的基因分型結果,分析受檢者對抗腫瘤藥物的療效和毒副作用。
2.如權利要求1所述的常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片,其特征在于:所述步驟2)中的rs505922的引物是SEQ?ID?NO:1~2所示序列的引物、rs2294008的引物是SEQ?ID?NO:3~4所示序列的引物、rs2279744的引物是SEQ?ID?NO:5~6所示序列的引物、rs738409的引物是SEQ?ID?NO:7~8所示序列的引物、rs2274223的引物是SEQ?ID?NO:9~10所示序列的引物、rs667282的引物是SEQ?ID?NO:11~12所示序列的引物、rs6983267的引物是SEQ?ID?NO:13~14所示序列的引物、rs2231142的引物是SEQ?ID?NO:15~16所示序列的引物。
3.如權利要求1所述的常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片,其特征在于:所述步驟2)中的片段化是將純化的PCR產物經測定濃度后,用DNase?I進行片段化;
所述熒光素標記是將片段化PCR產物利用脫氧核苷酸轉移酶在3’末端進行熒光素標記。
4.如權利要求1所述的常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片,其特征在于:所述步驟3)基因芯片的制備是將預先設計并合成好的探針通過接觸式點樣或噴墨式點樣點載到玻片或硅片材質的固相載體片基上,其中,探針是SEQ?ID?NO:17~SEQ?ID?NO:32所示序列的DNA探針。
5.如權利要求1或4所述的檢測芯片,其特征在于,所述探針為DNA、RNA、DNA-RNA嵌合體、PNA或其衍生物。
6.如權利要求2所述的引物,其特征在于,所述引物含有SEQ?ID?NO:1~SEQ?ID?NO:16所示序列的核苷酸鏈或其互補鏈。
7.如權利要求1所述的常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片,其特征在于:所述步驟4)中的基因分型結果根導入分析軟件對受檢者常見惡性腫瘤的易感性進行評估。
8.如權利要求1或7所述的常見惡性腫瘤易感基因檢測芯片,其特征在于:所述常見惡性腫瘤包括乳腺癌、肺癌、胃癌、前列腺癌、胰腺癌、膀胱癌、肝癌、白血病、食管癌和結直腸癌。
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