[發(fā)明專利]唐氏綜合征21號染色體相關(guān)miRNA、基因、篩選方法和應(yīng)用無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210555209.5 | 申請日: | 2012-12-20 |
| 公開(公告)號: | CN103045596A | 公開(公告)日: | 2013-04-17 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 徐勇;李武縣;戴勇 | 申請(專利權(quán))人: | 徐勇 |
| 主分類號: | C12N15/113 | 分類號: | C12N15/113;C12Q1/68;C12N15/10 |
| 代理公司: | 廣州華進(jìn)聯(lián)合專利商標(biāo)代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
| 地址: | 518118 廣東省*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 綜合征 21 染色體 相關(guān) mirna 基因 篩選 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種與唐氏綜合征21號染色體相關(guān)的miRNA基因,具有如SEQ?ID?NO.1的核苷酸序列。
2.如權(quán)利要求1所述的miRNA基因在制備診斷或檢測唐氏綜合征試劑中的應(yīng)用。
3.如權(quán)利要求1所述的miRNA基因在制備診斷或檢測唐氏綜合征基因檢測芯片中的應(yīng)用。
4.一種與唐氏綜合征21號染色體相關(guān)的miRNA的前體,具有如SEQ?IDNO.2的核苷酸序列。
5.如權(quán)利要求1所述的miRNA的前體在制備診斷或檢測唐氏綜合征試劑中的應(yīng)用。
6.如權(quán)利要求1所述的miRNA的前體在制備診斷或檢測唐氏綜合征試劑中的應(yīng)用。
7.一種與唐氏綜合征21號染色體相關(guān)的miRNA,具有如SEQ?ID?NO.3的核苷酸序列。
8.如權(quán)利要求1所述的miRNA在制備診斷或檢測唐氏綜合征試劑中的應(yīng)用。
9.如權(quán)利要求1所述的miRNA在制備診斷或檢測唐氏綜合征基因檢測芯片中的應(yīng)用。
10.一種唐氏綜合征21號染色體相關(guān)miRNA的篩選方法,其特征在于,包括如下步驟:
分別采集唐氏綜合征胎兒和正常胎兒的臍帶血單個核細(xì)胞樣品;
提取所述樣品中的總RNA,用變性聚丙烯胺凝膠電泳分離回收長度不大于30個核苷酸的小RNA,在T4RNA連接酶的作用下,在回收的小RNA的5’端加上如SEQ?ID?NO.4的核苷酸序列接頭,3’端加上如SEQ?ID?NO.5的核苷酸序列接頭,經(jīng)TBE聚丙烯胺凝膠電泳純化后,經(jīng)Solexa小RNA反轉(zhuǎn)錄引物和PCR擴(kuò)增后制成小RNA的cDNA文庫,再使用TBE聚丙烯胺凝膠電泳對所述cDNA文庫進(jìn)行純化并進(jìn)行測序分析;
對測序后所得的小RNA分子進(jìn)行去接頭和去污染處理,并從中篩選出長度為18~30nt的核苷酸序列,用SOAP軟件將所得序列與人全基因組序列進(jìn)行比對分析,將匹配上的序列按照GenBank>Rfam>miRBase17.0>repeat>exon>intron的優(yōu)先級順序進(jìn)行分類注釋,然后將intron和未比對上序列的小RNA分子序列作為新miRNA的數(shù)據(jù)源,用MIREAP和MiPred兩種軟件對所述新miRNA所在的染色體進(jìn)行分析,得到所述唐氏綜合征21號染色體相關(guān)miRNA。
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