[發(fā)明專利]一種檢測 TUBB3 mRNA 基因表達量的試劑盒及方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210521384.2 | 申請日: | 2012-12-07 |
| 公開(公告)號: | CN103088124A | 公開(公告)日: | 2013-05-08 |
| 發(fā)明(設計)人: | 張偉;郭成賢;陳小平;劉昭前;周宏灝 | 申請(專利權(quán))人: | 周宏灝 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 長沙正奇專利事務所有限責任公司 43113 | 代理人: | 盧宏 |
| 地址: | 410078 湖南省長沙市開*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 檢測 tubb3 mrna 基因 表達 試劑盒 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種檢測?TUBB3?mRNA?基因表達量的試劑盒及方法。
背景技術(shù)
抗微管類藥物是一類以細胞微管蛋白為作用靶點的藥物。通過作用于細胞微管而影響紡錘體形成,并抑制細胞有絲分裂的一類廣譜化療藥。目前常用的抗微管類藥物主要有:紫杉醇、多西他賽、長春堿、長春新堿和長春瑞濱等。紫杉醇/多西他賽作用于腫瘤細胞后,可以促進腫瘤細胞內(nèi)的微管聚合以及穩(wěn)定已聚合的微管,導致細胞內(nèi)大量微管聚集,進而干擾細胞各種功能,特別是使細胞停止分裂。長春堿/長春新堿等可以抑制腫瘤細胞內(nèi)微管蛋白的聚合、抑制紡錘體微管的形成,使核分裂停滯于細胞分裂中期,從而抑制腫瘤細胞生長。
微管蛋白α和微管蛋白β構(gòu)成的α,β異二聚體是微管裝配的基本單位,也是許多抗微管類藥物的作用靶點。其中TUBB3編碼的β-tubulin-Ⅲ(Ⅲ型微管蛋白)與抗微管類藥物的療效關(guān)系最為密切。
多種腫瘤細胞系的研究及大量臨床試驗結(jié)果均顯示TUBB3?mRNA的表達水平與抗微管類藥物的療效密切相關(guān)?(Pascal?S?and?Charles?D.?Lancet?Oncol.?2008;9:168-75.)?。低表達患者接受紫杉醇類或長春堿類化療的效果較好,中位生存期較長。而TUBB3高表達的患者的抗微管類化療療效較差?(Pascal?S?and?Charles?D.?Lancet?Oncol.?2008;9:168-75.)?。
熒光定量PCR技術(shù)的出現(xiàn),為本發(fā)明提供了一種操作簡單快速、易標準化、檢測費用低,準確可靠、定量檢測mRNA的方法。通過該方法可以快速檢測腫瘤細胞?(來源于腫瘤組織、循環(huán)腫瘤細胞、穿刺標本、胸腹水等)?中TUBB3?mRNA的表達量,用于臨床醫(yī)生對抗微管類的合理化使用。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明旨在提供一種檢測?TUBB3?基因mRNA表達量的熒光定量PCR檢測試劑盒,能簡單快速、準確可靠的檢測TUBB3基因。
為了達到上述目的,本發(fā)明提供的技術(shù)方案為:
一種檢測TUBB3基因表達量的熒光定量PCR試劑盒,包含以下組成部分:
(1)TUBB3基因標準品:含有TUBB3基因編碼序列的重組載體,所述TUBB3基因編碼序列如SEQ?ID?NO.1所示;
(2)檢測TUBB3基因的上、下游引物:
TUBB3-上游引物:5’-?GGCCTCTTCTCACAAGTACG?-3’(SEQ?ID?NO.2)
TUBB3-下游引物:5’-?GAAGAGATGTCCAAAGGCCC?-3’(SEQ?ID?NO.3)
進一步,所述含有TUBB3基因編碼序列的重組載體的空載體為pUC57載體;
進一步,該試劑盒還包含逆轉(zhuǎn)錄緩沖液、逆轉(zhuǎn)錄引物Oligo-(dT)、dNTPs溶液、M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶、定量PCR緩沖液和TaqDNA聚合酶。
所述逆轉(zhuǎn)錄緩沖液為常規(guī)逆轉(zhuǎn)錄緩沖液,如5×逆轉(zhuǎn)錄緩沖液?(有濃度為50mmol/L、pH為8.0的Tris-HCl、濃度為50mmol/L的KCl、濃度為4?mmol/L的MgCl2和濃度為10mmol/L的二硫蘇糖醇DTT組成)?等;所述逆轉(zhuǎn)錄引物?Oligo-(dT)?為寡聚脫氧胸腺嘧啶核苷酸;所述?dNTPs?溶液為?dATP?(脫氧腺苷三磷酸)?的混合水溶液;所述定量?PCR?緩沖液為常規(guī)定量?PCR?緩沖液,如5×定量?PCR?緩沖液?(由濃度為10mmol/L,pH為8.0的Tris-HCl、濃度為50mmol/L?的?KCl?和濃度為2?mmol/L的?MgCl2?組成)?等。
本發(fā)明還提供了基于上述試劑盒檢測?TUBB3?mRNA?基因表達量的方法,包括以下步驟:
(1)從待測標本?(腫瘤組織、循環(huán)腫瘤細胞、穿刺標本、胸腹水等)?中提取細胞總RNA,測定RNA濃度,加入逆轉(zhuǎn)錄緩沖液、逆轉(zhuǎn)錄引物Oligo-(dT)、dNTPs溶液和M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶,將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA;
(2)分別將已知拷貝數(shù)的TUBB3基因標準品倍比稀釋至108、107、106、105、104、103、102、10個拷貝數(shù)/μl;
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