[發(fā)明專利]EXT1基因突變體及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201210487332.8
• 申請日: 2012-11-26
• 公開（公告）號: CN103834673B
• 公開（公告）日: 2018-09-04
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 張峰;郭雄;馬瑋娟;文嫣;武世勛;梁金龍;戴蘭蘭;劉軒竹;王俊;汪建;楊煥明
• 申請（專利權(quán)）人: 深圳華大基因股份有限公司
• 主分類號: C12N15/54
• 分類號: C12N15/54;C12N9/10;C12Q1/6883
• 代理公司: 北京清亦華知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11201
• 代理人: 李志東

本發(fā)明公開了EXT1基因突變體及其應(yīng)用，具體涉及分離的編碼EXT1突變體的核酸，分離的多肽，篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的方法，篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的系統(tǒng)，用于篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的試劑盒以及篩選治療或預(yù)防遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的藥物的方法。其中，該分離的編碼EXT1突變體的核酸，與SEQ ID NO：1相比，具有c.1457?1458insG突變。通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及EXT1基因突變體及其應(yīng)用。具體地，本發(fā)明涉及分離編碼EXT1突變體的核酸，分離的多肽，篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的方法，篩選遺憾遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的系統(tǒng)，用于篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的試劑盒以及篩選治療或預(yù)防遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的藥物的方法。

背景技術(shù)

遺傳性多發(fā)性軟骨瘤（Hereditary multiple exostoses，HME）是一種骨骼系統(tǒng)的良性腫瘤，易發(fā)于兒童，常見于長骨干骺端，亦可累及骨盆和肋骨，較少見于椎骨和腕骨等。遺傳性多發(fā)性軟骨瘤患者主要表現(xiàn)為疼痛、長骨干骺端多發(fā)性外生性骨疣形成。此外，瘤體生長可阻止骨的生長，并壓迫鄰近神經(jīng)和血管組織，導(dǎo)致骨骼畸形、身材矮小和關(guān)節(jié)活動(dòng)受限。遺傳性多發(fā)性軟骨瘤人群發(fā)病率約為1/5000，其中近5%的遺傳性多發(fā)性軟骨瘤會(huì)惡變成骨肉瘤和軟骨肉瘤。雖然目前已發(fā)現(xiàn)一些遺傳性多發(fā)性軟骨瘤的致病基因，但仍存在著相當(dāng)一部分未知致病基因位點(diǎn)。

因而，目前對遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的研究仍有待深入。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的附加方面和優(yōu)點(diǎn)將在下面的描述中部分給出，部分將從下面的描述中變得明顯，或通過本發(fā)明的實(shí)踐了解到。

本發(fā)明旨在至少解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的技術(shù)問題之一。為此，本發(fā)明的一個(gè)目的在于提出一種能夠有效篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的方法。

本發(fā)明是基于發(fā)明人的下列工作完成的：發(fā)明人通過高通量外顯子組測序聯(lián)合候選基因突變驗(yàn)證的方法確定了遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病新的致病基因突變位點(diǎn)（EXT1基因的8號外顯子c.1457-1458insG）。

根據(jù)本發(fā)明的第一方面，本發(fā)明提出了一種分離的編碼EXT1突變體的核酸。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，所述核酸與SEQ ID NO：1相比，具有c.1457-1458insG突變，即相對于野生型EXT1基因，本發(fā)明的EXT1基因突變體在第1457位和第1458位堿基之間插入堿基G，也可以是在第1458位和第1459位或者在第1459位和第1460位插入堿基G。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，發(fā)明人確定了遺傳性多發(fā)性軟骨瘤的新突變體，該突變體與遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的發(fā)病密切相關(guān)，從而通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病。

根據(jù)本發(fā)明的第二方面，本發(fā)明提出了一種分離的多肽。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，與SEQID NO：2相比，所述分離的多肽具有p.V487G突變，即該突變是由于c.1457-1458insG的移碼突變而引起的，具體地，該突變表示：從第487位開始的33個(gè)氨基酸改變?yōu)镚DPPGLSVPASVEASRGCSQVPVLCPDHSSMEL，且翻譯提前終止于第519位氨基酸。通過檢測生物樣品中是否表達(dá)該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病。

根據(jù)本發(fā)明的第三方面，本發(fā)明提出了一種篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的方法。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該方法包括以下步驟：從所述生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO：1相比，具有c.1457-1458insG突變是所述生物樣品易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的指示。通過根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品的方法，可以有效地篩選易患遺傳性多發(fā)性軟骨瘤疾病的生物樣品。