[發明專利]一種與玉米GPAT基因連鎖的SNP位點及其應用有效
| 申請號: | 201210444681.1 | 申請日: | 2012-11-09 |
| 公開(公告)號: | CN102899324A | 公開(公告)日: | 2013-01-30 |
| 發明(設計)人: | 嚴建兵;楊小紅;李建生;李慧 | 申請(專利權)人: | 華中農業大學 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68;A01H1/04 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 430070 *** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 玉米 gpat 基因 連鎖 snp 及其 應用 | ||
1.一種與玉米GPAT基因連鎖的SNP位點,其特征在于,所述的SNP位點與玉米油份含量相關,與玉米甘油-3-磷酸酰基轉移酶(GPAT)基因緊密連鎖,位于玉米參考基因組(www.maizesequence.org,5a.60版)chr3.S_178136002上,該位點突變為G/C。?
2.如權利要求所述的SNP位點的應用,包括以下步驟:?
a)由473個普通玉米自交系和35個高油玉米自交系組成AM508群體;?
b)從授粉15天后的AM508份自交系中隨機選擇368份自交系,構建200bp大小插入片段文庫,采用90bp末端配對的RNA測序技術進行轉錄組測序;?
c)利用3個群體進行連鎖分析:高油玉米自交系By804與普通玉米自交系B73衍生的重組自交系,利用包含1536個SNP標記的GoldenGate芯片對家系及其親本進行基因型鑒定,利用Mapmaker3.0軟件構建連鎖圖,采用復合區間作圖法進行QTL定位;?
d)結合F2、F2:3兩個世代群體油份含量的測定結果,利用軟件QTL?cartographer?V2.5,采用復合區間作圖法篩選與油份含量緊密連鎖的QTL位點;篩選到在F2和F2:3兩個世代均能穩定表達的油份含量主效QTL。
3.如權利要求1或2所述的玉米油份含量相關的SNP位點在玉米育種的應用。?
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