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[發明專利]一種八寶景天基因組DNA的提取方法無效

專利信息
申請號: 201210438729.8 申請日: 2012-11-07
公開(公告)號: CN102876665A 公開(公告)日: 2013-01-16
發明(設計)人: 周祥明;宋建;王姝 申請(專利權)人: 天津市農業生物技術研究中心
主分類號: C12N15/10 分類號: C12N15/10
代理公司: 天津市杰盈專利代理有限公司 12207 代理人: 朱紅星
地址: 300384 天*** 國省代碼: 天津;12
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 八寶 景天 基因組 dna 提取 方法
【說明書】:

技術領域

發明涉及分子生物學實驗中植物基因組DNA的分離提取技術,具體涉及一種八寶景天基因組DNA的提取方法。

背景技術

八寶景天(Sedum?spectabile)是景天科景天屬肉質草本植物,性喜強光,耐貧瘠和干旱,也能耐-25℃的低溫,管理粗放,病蟲害少,是一種不可多得的優良園林綠化材料。作為景觀工程,八寶景天的群體綠化效果極佳,也是很好的模紋材料。同時可以全草入藥,具有祛風利濕,活血散瘀,止血止痛的功效。八寶景天中含有豐富的多糖和其他次生代謝產物,這讓它具有了較高的利用價值,但同時給其基因組DNA的提取也帶來了較大的困難。由于多糖的某些物理性質與核酸極為相似,在沉淀DNA過程中,多糖與DNA發生共沉淀而難以分離,因而影響了所提取的DNA質量,使得無法以DNA為模板進行后續的實驗研究。

基因組DNA的提取是分子生物學研究中的關鍵環節之一。所提取的基因組DNA的質量和產量將直接影響分子生物實驗中與DNA有關的下游實驗。目前,已報道了多種植物DNA提取方法,筆者通過研究發現,多數DNA提取方法并不適用于景天植物的DNA提取如常規CTAB法和SDS法,這些提取方法僅對含有極少量多糖、多酚等植物有效,而對于多糖、多酚等含量高的植物基本無效。有些方法雖然能夠獲得基因組DNA,但所提取的基因組DNA質量不高,而且整個操作復雜。筆者在前人研究的基礎上,經過大量的研究實驗,在常規CTAB提取方法的基礎上,經過改良獲得了一種高效提取景天植物基因組DNA的方法。此方法在操作步驟上與常規CTAB基本相同,但在提取液方面添加了可溶性PVP和SDS,另外,加大了β-巰基乙醇量,使得所提取的景天基因組DNA質量大大提高,可用于后續實驗研究。

發明內容

本發明的目的在于針對八寶景天富含多糖、多酚、多蛋白及自身組織的特點,提出了一種八寶景天基因組DNA提取方法。為實現此目的本發明公開了如下的技術內容:

一種八寶景天基因組DNA的提取方法,其特征在于按以下的步驟進行:

(1)取0.2g新鮮葉片放入研缽中,加入0.02g-0.04g石英砂,用液氮充分研磨成粉末,加入預熱的0.5mL?2%CTAB提取液溶解;

所述的2%CTAB混合提取液是由下述原料組成:

2%CTAB??????????????????????2g/100mL

2%SDS???????????????????????2g/100mL

2%PVP、?????????????????????2g/100mL

pH值為8.0的0.1mol/LTris-Cl????1.1214g/100mL

20mmol/LEDTA????????????????0.744g/100mL

1.4mol/LNaCl??????????????????8.19g/100mL

10%的β-巰基乙醇?????????????10ml/100mL。

(2)在55℃~65℃下溫浴45分鐘,取出冷卻后再加入0.5-1mL氯仿-異戊醇混合液,常溫下12000-15000轉/分,離心10-15分鐘;其中氯仿與異戊醇的體積比為24∶1;?

(3)取上清液轉入新離心管,再加入等體積的氯仿-異戊醇混合液(其中氯仿與異戊醇的體積比為24∶1),常溫下12000-15000轉/分,離心10-15分鐘;?

(4)取上清液再轉入新離心管,并加入上清液2/3體積的冰冷異丙醇混合,-20℃條件下放置15-30分鐘沉淀DNA;?

(5)8-10℃,12000-15000轉/分,離心10-15分鐘,棄上清液,回收沉淀,用70%乙醇洗滌2次,風干后加入pH值為8.0的TE緩沖液80-100μl;然后加入5-8μL?RNase,37℃保溫1-1.5小時,置于-20℃條件下保存;所述的TE緩沖液包括:10mmol/L?pH=8.0的Tris-Cl和1mmol/L的EDTA。

本發明所述的提取方法,其中步驟(5)所使用的RNase,儲藏濃度為10mg/mL,終濃度為0.5mg/mL。

上述步驟(1)所使用的2%CTAB提取液包括:2%CTAB、2%SDS、2%PVP、0.1mol/LTris-HCl(pH=8.0)、20mmol/L的EDTA、1.4mol/L的NaCl以及10%的β-巰基乙醇。

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